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可米kemi

银虫 (小有名气)

[求助] 生成热(HF)结果与其中氢键作用力等分析结果相反,求解。

大家好:
    我对某药和环糊精的包合物进行NBO计算.结果打开计算结果的文本框后发现:
    在文本的最后结果中R构型的HF=-5363.6520546,S构型的HF=-5363.64425.
那按理来说应该R型的稳定些。(和实验结果也符合)
    结果在做其中氢键、静电作用、偶极作用分析的时候,问题来了。
    1.氢键分析中,S构型的E(2)略微比R构型的大些,当然这一块我自己本身也还存在怀疑,因为关于氢键的数据我有些拿捏不准应该选那些。是应该选E(2)>2.09KJ/MOL的,还是只要符合能形成氢键的都选上。如果是后者的话,那就太多了,象o....H-O,F....H-O,特别是C-H.....H-C。
   2.然后是静电作用,我把包合物中的小分子拿出来,然后算出小分子的总电荷,结果R是 -0.00497 ,S是-0.01196(原本未包结的小分子电荷为0) ,根据每0.0001个电荷转移相当于4。18709KJ/MOL能量,那不是S>R?
   3.然后是偶极相互作用R=12.0947 , S=14.7282 .
     请高手帮我分析分析到底是哪里出了问题,谢谢。
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showcat

金虫 (小有名气)

请问,你是如何将氢键作用、静电作用和偶极作用区分开的呢?我的理解是氢键作用和偶极-偶极作用应该都属于静电作用,所以想请教一下,你用的什么级别的泛函什么关键词呢?
化工人,初入计算领域
2楼2012-04-14 10:38:28
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