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fly_elephan

银虫 (小有名气)

[求助] vasp计算能带,刚开始就服务器就卡了 已有1人参与

如题,本人用的是联想服务器,16核,内存12G,虚拟内存24G,vasp并行计算一个53原子的体系,刚开始cpu效率逐渐上升至96%左右,接着有点卡,top命令查看内存12G已经用得差不多只剩300M了,然后cpu利用率只有0.3%了。之前算过52个原子的体系,用一个周也可以算完,但这次53个原子的体系却几近死机,请高手分析一下原因。
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

贺仪

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
liliangfang(金币+2): 多谢指教 2012-03-08 08:32:21
算能带的时候k点数很多,需要的内存自然就会很大,楼主可以尝试不同的高对称点之间分开来算,每次只算一天线

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

嘟啦啦嘟啦啦嘟
6楼2012-03-07 22:40:44
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贺仪

铁杆木虫 (著名写手)

★ ★
fzx2008(金币+2): 谢谢指教 2012-03-08 21:46:22
引用回帖:
9楼: Originally posted by fly_elephan at 2012-03-08 15:00:50:
可以详细说一下怎么分吗,这是我的KPOINTS
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分三次计算第一次用
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二次
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三次
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每算一次画出能带,最后把三张连在一起就可以了
嘟啦啦嘟啦啦嘟
10楼2012-03-08 20:51:29
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普通回帖

liliangfang

荣誉版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与,应助指数 +1
fzx2008(金币+1): 谢谢交流! 2012-03-06 22:28:39
呵呵物理内存不够哦
2楼2012-03-06 22:26:17
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fzx2008

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
liliangfang(金币+2): 多谢指教 2012-03-07 08:43:14
不光是比原子个数,更重要的是电子个数!
3楼2012-03-06 23:07:18
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fly_elephan

银虫 (小有名气)

感谢提示我把自旋去掉看一看速度如何?
4楼2012-03-07 20:31:14
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09njtpw

铁杆木虫 (职业作家)

★
贺仪(金币+1): 谢谢参与讨论 2012-03-07 22:39:44
应该跟体系的对称性有点关系吧。。。对称性不好的需要的资源和时间估计就。。。
5楼2012-03-07 20:57:10
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aaq2800

铁杆木虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

★
感谢参与,应助指数 +1
liliangfang(金币+1): 多谢指教 2012-03-08 08:32:33
如果是过渡金属,电子数目多,很耗内存的,跟简单金属不一样,16核怎么着得弄32G内存把
7楼2012-03-08 08:21:02
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uuv2010

荣誉版主 (职业作家)

优秀版主

【答案】应助回帖

★
感谢参与,应助指数 +1
WDD880227(金币+1): 感谢交流提示 2012-03-08 13:48:14
引用回帖:
6楼: Originally posted by 贺仪 at 2012-03-07 22:40:44:
算能带的时候k点数很多,需要的内存自然就会很大,楼主可以尝试不同的高对称点之间分开来算,每次只算一天线

这是一个好办法,应该计算能带的时候是相互不影响的,所以可以分开来计算
8楼2012-03-08 13:35:15
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fly_elephan

银虫 (小有名气)

送鲜花一朵
引用回帖:
楼: Originally posted by 贺仪 at 2012-03-07 22:40:44:
算能带的时候k点数很多,需要的内存自然就会很大,楼主可以尝试不同的高对称点之间分开来算,每次只算一天线

可以详细说一下怎么分吗,这是我的KPOINTS
k-points along high system G-F
20
Line-mode
rec
0.333333 0.666667 0.0 !K
0.0 0.0 0.0 !G
0.0 0.0 0.0 !G
0.5 0.5 0.0 !M
9楼2012-03-08 15:00:50
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