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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » ms画图碳原子间键的连接？
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jianying8996

木虫 (著名写手)

科学社会主义人道救援幸福组织

[求助] ms画图碳原子间键的连接？

用MS作图时碳原子之间的键并没有连接，但是距离测量显示这两个原子间间距要只有1.24埃，连接的只有1.3~1.5埃。不知道为什么，求助解答！
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1楼 2012-03-05 09:09:42
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350735697

银虫 (小有名气)
★ ★
御剑江湖(金币+2): 呵呵，谢谢 2012-03-07 22:24:42
意思没有表达清楚吧！是你优化完了，还是建立模型的时候。“连接的只有1.3~1.5埃”什么意思？
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jianying8996
2楼2012-03-05 11:48:01
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jianying8996

木虫 (著名写手)

科学社会主义人道救援幸福组织
引用回帖:
2楼: Originally posted by 350735697 at 2012-03-05 11:48:01:
意思没有表达清楚吧！是你优化完了，还是建立模型的时候。“连接的只有1.3~1.5埃”什么意思？

优化完成之后的！能显示碳键的间距测量是1.3到1.46埃，而间距是1.24的两个碳原子为什么没有显示碳键？
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3楼2012-03-05 13:18:41
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jianying8996

木虫 (著名写手)

科学社会主义人道救援幸福组织
送鲜花一朵
引用回帖:
楼: Originally posted by 350735697 at 2012-03-05 11:48:01:
意思没有表达清楚吧！是你优化完了，还是建立模型的时候。“连接的只有1.3~1.5埃”什么意思？

希望指点！
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4楼2012-03-05 19:19:00
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qyyos

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
jianying8996(金币+2): ★有帮助 谢谢指导 2012-03-06 10:39:02
御剑江湖(金币+1): 呵呵，谢谢 2012-03-07 22:24:59
修改下display style？
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心有猛虎,细嗅蔷薇.
5楼2012-03-06 09:00:25
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350735697

银虫 (小有名气)
★ ★
御剑江湖(金币+2): 呵呵，谢谢 2012-03-07 22:25:22
引用回帖:
3楼: Originally posted by jianying8996 at 2012-03-05 13:18:41:
优化完成之后的！能显示碳键的间距测量是1.3到1.46埃，而间距是1.24的两个碳原子为什么没有显示碳键？

你能把你那两个碳原子周围原子分布截图发过来吗？
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6楼2012-03-06 10:30:26
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jianying8996

木虫 (著名写手)

科学社会主义人道救援幸福组织
引用回帖:
6楼: Originally posted by 350735697 at 2012-03-06 10:30:26:
你能把你那两个碳原子周围原子分布截图发过来吗？

那是两个富勒烯的结合，是因为设置的截断参数的原因吗？
在VMD下显示两个碳原子是连接的，是在不知道这是为什么？请求解答！
四周还有几个分子，没有全部的截图，我的疑问是圈中的碳碳键的问题。
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7楼2012-03-06 10:54:11
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350735697

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
jiaoyixiong(金币+3): 鼓励交流 2012-03-07 07:59:51
jianying8996(金币+6): ★★★很有帮助 谢谢您的解答！ 2012-03-07 16:09:46
这种情况在量化计算中没关系，不影响后期计算。如果你需要图片，为了避免误解，你可以要么改变默认显示的键长范围，要么在其他软件中显示。
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8楼2012-03-06 22:15:20
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jianying8996

木虫 (著名写手)

科学社会主义人道救援幸福组织
引用回帖:
楼: Originally posted by 350735697 at 2012-03-06 22:15:20:
这种情况在量化计算中没关系，不影响后期计算。如果你需要图片，为了避免误解，你可以要么改变默认显示的键长范围，要么在其他软件中显示。

再问一下如何在MS中设置键长显示范围？
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9楼2012-03-07 16:12:30
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350735697

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
御剑江湖(金币+2): 呵呵，谢谢 2012-03-07 22:25:35
引用回帖:
8楼: Originally posted by 350735697 at 2012-03-06 22:15:20:
这种情况在量化计算中没关系，不影响后期计算。如果你需要图片，为了避免误解，你可以要么改变默认显示的键长范围，要么在其他软件中显示。

Build → Bonds → connectivity options
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10楼2012-03-07 21:29:00
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