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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 表面计算时出错，请教各位
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ning_8023cui

金虫 (初入文坛)

[求助] 表面计算时出错，请教各位

把分子复制粘贴到表面上，总是出现这个对话框，有人说是参数设置不对，请问具体是什么原因？请教各位！谢谢！
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冷暖自知
1楼 2012-03-04 17:52:04
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jinzhulin000

金虫 (小有名气)

NB虫

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
WDD880227(金币+1): 感谢交流提示 2012-03-05 09:04:16
你的两个结构都是周期性的，建议你在构建分子的时候不要构建立方格子，然后复制就可以粘贴进有表面的立方格子了。
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走虫子的路，让虫子无路可走
2楼2012-03-05 08:58:39
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kmw.8668

金虫 (正式写手)

归期守望者

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
WDD880227(金币+1): 感谢交流提示 2012-03-05 09:04:39
"It is possible to combine this with an existing structure"这说明软件提示你这种做法是不对的！！你可以在MS中建好表面以后，通过添加原子的方式把分子加到表面上
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臾兮，臾兮，何时是归期！
3楼2012-03-05 08:59:13
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kmw.8668

金虫 (正式写手)

归期守望者

【答案】应助回帖

★
WDD880227(金币+1): 感谢交流提示 2012-03-05 09:04:53
在MS中通过build－add atoms，然后输入添加的原子坐标。或者MS中有一个铅笔形状的按钮，点击一下就可添加原子了
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臾兮，臾兮，何时是归期！
4楼2012-03-05 09:01:39
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ning_8023cui

金虫 (初入文坛)
引用回帖:
楼: Originally posted by jinzhulin000 at 2012-03-05 08:58:39:
你的两个结构都是周期性的，建议你在构建分子的时候不要构建立方格子，然后复制就可以粘贴进有表面的立方格子了。

我没有构建立方格子啊。我是用ChemDraw软件画好分子，然后复制到MS中的表面上，请问这样做是否可以呢？
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冷暖自知
5楼2012-03-05 09:48:02
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天棚元帅

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
zzy870720z(金币+2): 谢谢指教 2012-03-05 16:00:02
引用回帖:
5楼: Originally posted by ning_8023cui at 2012-03-05 09:48:02:
我没有构建立方格子啊。我是用ChemDraw软件画好分子，然后复制到MS中的表面上，请问这样做是否可以呢？

这样做的结果，MS已经明确告诉你不行了，也就是说ChemDraw画的分子结构并不能直接通过黏贴的方式导入MS。

为什么不直接利用MS把分子做出来呢？
或者先把分子结构文件import到MS里来（格式转换），然后再尝试黏贴操作
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A man gets what he earns when he earns it.
6楼2012-03-05 14:57:31
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ning_8023cui

金虫 (初入文坛)
引用回帖:
楼: Originally posted by 天棚元帅 at 2012-03-05 14:57:31:
这样做的结果，MS已经明确告诉你不行了，也就是说ChemDraw画的分子结构并不能直接通过黏贴的方式导入MS。

为什么不直接利用MS把分子做出来呢？
或者先把分子结构文件import到MS里来（格式转换），然后再尝试 ...

那我试试直接用MS把分子做出来。还要请问您，分子结构文件是什么格式的，才能import到MS呢？谢谢啦~~
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冷暖自知
7楼2012-03-05 17:39:14
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天棚元帅

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
franch(金币+2): 谢谢回帖交流。。。。 2012-03-05 21:36:58
引用回帖:
7楼: Originally posted by ning_8023cui at 2012-03-05 17:39:14:
那我试试直接用MS把分子做出来。还要请问您，分子结构文件是什么格式的，才能import到MS呢？谢谢啦~~

格式很多，常用商业软件绘制出的分子结构文件保存时一般是可以选择保存类型的，MS应该都能导入，我常用的是.cif和.mol格式的，希望有帮助~
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A man gets what he earns when he earns it.
8楼2012-03-05 20:32:32
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