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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 对称分子的模拟建立
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jixiao0526

金虫 (小有名气)

[求助] 对称分子的模拟建立

我想建一个高对称性的物质（比如说像萘一样，但不是萘），但是又不能从MS直接导入，而且不能在晶体数据库中找到，只能手工画，而且不能找到晶格参数，我该怎么建呢？
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1楼2012-03-04 17:06:14
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o58285880

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
zh1987hs(金币+1): 谢谢 2012-03-13 12:57:49
看ICSD里面有没有 去下个过期的晶体数据库，改下计算机时间就能用了。
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。。。。。。
3楼2012-03-13 12:13:36
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ChemiAndy

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
jiaoyixiong(金币+3): 鼓励交流 2012-03-05 08:48:30
楼主要建立的是晶体结构吗？那你这相当于从分子结构预测晶体堆积方式，是晶体研究中一个难点，迄今没有可靠的方法。因为很难确定一个单胞包括几个分子，此外，一个物质可能有多种晶型。
我记得MS中有个模块好像是 forcite ，能帮你把自己预先搭建的“晶体结构”进行堆积方式搜索，得到一些能量较低的结构，但结果依赖于你初始搭的盒子里面的分子数目。
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2楼2012-03-04 22:58:38
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jixiao0526

金虫 (小有名气)
引用回帖:
楼: Originally posted by o58285880 at 2012-03-13 12:13:36:
看ICSD里面有没有 去下个过期的晶体数据库，改下计算机时间就能用了。

没有的，谢谢
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4楼2012-03-14 08:38:02
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o58285880

银虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by jixiao0526 at 2012-03-14 08:38:02:
没有的，谢谢

原子多不多啊 不多的话直接手动画，先找个相似的分子 在那个基础上直接改就 可以了。不用一个一个原子去画。
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。。。。。。
5楼2012-03-14 11:59:41
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