| 查看: 1224 | 回复: 0 | ||
budgerigar木虫 (小有名气)
|
[求助]
请教关于模拟退火的问题
|
|
今天上午在邮件列表里看到一个教授回复的内容，他提到可以用模拟退火的方法让体系能快速平衡，原文如下： http://lists.gromacs.org/piperma ... January/013820.html有几个问题请教一下： 1. 教授指出，他是对膜进行退火，之后再添加水分子，那是否可以将体系准备完成后再退火，将体系分为各个温度组进行退火？ 2. 如果可以，那模拟的顺序是什么呢，我做的是油-表面活性剂-水-表面活性剂-油的体系，是不是应该这样，em-annealing-nvt-npt.... 4. 退火产生速度吗，需要不需要在后面的模拟里面用gen_vel=yes产生速度？ 5. 退火对系综的要求是什么，npt可以吗，是不是只需要将退火那部分参数加到mdp文件中即可，其中把ref_t扔掉 6. annealing_time，annealing_temp的设置有什么注意的吗？希望大家能贴一个正确的mdp出来让小弟参考一下。 这么多问题，麻烦大家了，刚接触退火，不知道里面说的有问题没，请大家指正。 |
回复此楼» 猜你喜欢
0703总分331求调剂
已经有6人回复
-
085600，321分求调剂
已经有7人回复
-
325求调剂
已经有4人回复
-
085600，320分求调剂
已经有12人回复
-
一志愿0817化学工程与技术，求调剂
已经有27人回复
-
一志愿北京化工085600 310分求调剂
已经有8人回复
-
一志愿哈尔滨工业大学085600英一数二337分求调剂
已经有10人回复
-
22408求调剂 354分 可跨专业
已经有3人回复
-
277工科求调剂
已经有4人回复
-
一志愿沪9，求生物学调剂，326分
已经有3人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
找到一些相关的精华帖子，希望有用哦~
请教一个关于闭合回路环流的fluent模拟问题
已经有17人回复
- 关于线圈施加电流的问题？请教下大家。。。呵呵
已经有6人回复
- 【讨论】请教大家几个问题，一直理解不透
已经有4人回复
- 【讨论】关于md中系统稳定的问题
已经有10人回复
点击这里搜索更多相关资源科研从小木虫开始，人人为我，我为人人
