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juzi121

金虫 (正式写手)

[求助] 晶体解析,checkcife的错误不会处理,请高手指点

Alert level A
PLAT780_ALERT_1_A Coordinates do not Form a Properly Connected Set          ?
Alert level B
PLAT035_ALERT_1_B No _chemical_absolute_configuration info given .          ?
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juzi121

金虫 (正式写手)

引用回帖:
: Originally posted by wormma at 2012-03-02 11:06:22:
问题1, 是说你的cif文件中提供的原子位置没有相互连接成一个有意义的分子或基团。
解决办法:用XP或其他绘图软件移动原子位置,使之相互链接,然后重新修正产生CIF即可。

问题2, 是说没有给出绝对构型信息。 ...

哦,非常感谢,第一个问题用绘图软件移动原子啊,这个可以吗,我不是很懂啊,我以为是在解析时候输入什么命令呢,然后第二个问题cife 填完会消失吗,这是与cife填写时候哪一栏有关啊,我好像之前没看过关于这个绝对构型的问题,呵呵,请您赐教啊
简简单单,活在自己幸福的世界里,幸运的是一直有好多的人关心我疼爱我
3楼2012-03-02 11:17:19
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wormma

木虫 (正式写手)

One for All, All for One

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ...
感谢参与,应助指数 +1
juzi121(金币+60): 2012-03-02 11:17:25
lichun1210(金币+3): 鼓励回帖~ 2012-03-02 11:34:25
问题1, 是说你的cif文件中提供的原子位置没有相互连接成一个有意义的分子或基团。
解决办法:用XP或其他绘图软件移动原子位置,使之相互链接,然后重新修正产生CIF即可。

问题2, 是说没有给出绝对构型信息。
解决办法:在cif中把相应信息填上。
OneforAll,AllforOne
2楼2012-03-02 11:06:22
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wormma

木虫 (正式写手)

One for All, All for One


huangjr(金币+1): 鼓励积极回帖交流`~ 2012-03-03 09:29:09
1,可以。但是也要重新修正,产生相应的新cif。
2,_chemical_absolute_configuration  在这个后面填相应内容。
    比如,如果没有确定绝对构型,填 unk 即可。
good luck。
OneforAll,AllforOne
4楼2012-03-02 11:30:02
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juzi121

金虫 (正式写手)

引用回帖:
: Originally posted by wormma at 2012-03-02 11:30:02:
1,可以。但是也要重新修正,产生相应的新cif。
2,_chemical_absolute_configuration  在这个后面填相应内容。
    比如,如果没有确定绝对构型,填 unk 即可。
good luck。

o ,太感谢你了,嘿嘿
简简单单,活在自己幸福的世界里,幸运的是一直有好多的人关心我疼爱我
5楼2012-03-02 20:15:05
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