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sk8er8irl

铁虫 (初入文坛)

[求助] 有用过PDB Viewer的吗?怎么能让分子显示new cartoon而不是默认的化学骨架模型?

今天找了半天都没找到,只知道怎么着色。教程上好像跳过这一部分了。像Rasmol、Raswin之类的软件都很好实现条带模型,但这个软件这个功能好像不是很显眼,但网上看别人的做出的图都显示的条带。希望有人用过该软件的人能指导一下。

大家有人用这个软件进行突变分析吗,怎么感觉突变后cartoon结构没有差异呢?

[ Last edited by 1949stone on 2012-2-29 at 18:46 ]
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flyme8373

银虫 (初入文坛)

★ ★
小丹木木(金币+2): 鼓励交流 2012-03-01 17:08:46
引用回帖:
3楼: Originally posted by sk8er8irl at 2012-02-29 23:23:51:
求解答啊求解答~~~

1.不知道楼主在进行突变处理后是否重新进行结构建模了?
2.如果更改的是一般的序列,那么细小的差别是不容易看到的,也很可能就没有差别
3.不知道楼主在进行突变处理后   结构建模用的是否为同源建模?如果是的话,结构没差异就太正常了
惠泽天下 尔我同行
4楼2012-03-01 12:58:26
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sk8er8irl

铁虫 (初入文坛)

刚刚这个问题得到了解答。现在想问大家有人用这个软件进行突变分析吗,怎么感觉突变后cartoon结构没有差异呢?
2楼2012-02-29 17:17:11
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sk8er8irl

铁虫 (初入文坛)

求解答啊求解答~~~
3楼2012-02-29 23:23:51
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sk8er8irl

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
: Originally posted by flyme8373 at 2012-03-01 12:58:26:
1.不知道楼主在进行突变处理后是否重新进行结构建模了?
2.如果更改的是一般的序列,那么细小的差别是不容易看到的,也很可能就没有差别
3.不知道楼主在进行突变处理后   结构建模用的是否为同源建模?如果是的 ...

恩,同源建模后没有太大差异我是了解的,这就是为什么 我原来用VMD1.9这个可视化软件 比较突变前后三维结构 发现没有差异 思考过的。
然后我听说PDB viewer这个软件自带mutation的分析,但不太会用,看到有些文献上有人用过,还比较了结构前后的变化。
针对第一个问题,想问下突变后的建模不用同源建模用什么可能能看到结构上的变化?谢谢回答。
5楼2012-03-01 14:45:13
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