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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 存档旧帖 » 有用过PDB Viewer的吗？怎么能让分子显示new cartoon而不是默认的化学骨架模型？
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sk8er8irl

铁虫 (初入文坛)

[求助] 有用过PDB Viewer的吗？怎么能让分子显示new cartoon而不是默认的化学骨架模型？

今天找了半天都没找到，只知道怎么着色。教程上好像跳过这一部分了。像Rasmol、Raswin之类的软件都很好实现条带模型，但这个软件这个功能好像不是很显眼，但网上看别人的做出的图都显示的条带。希望有人用过该软件的人能指导一下。

大家有人用这个软件进行突变分析吗，怎么感觉突变后cartoon结构没有差异呢？

[ Last edited by 1949stone on 2012-2-29 at 18:46 ]
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1楼 2012-02-29 16:01:40
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flyme8373

银虫 (初入文坛)
★ ★
小丹木木(金币+2): 鼓励交流 2012-03-01 17:08:46
引用回帖:
3楼: Originally posted by sk8er8irl at 2012-02-29 23:23:51:
求解答啊求解答~~~

1.不知道楼主在进行突变处理后是否重新进行结构建模了？
2.如果更改的是一般的序列，那么细小的差别是不容易看到的，也很可能就没有差别
3.不知道楼主在进行突变处理后   结构建模用的是否为同源建模？如果是的话，结构没差异就太正常了
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惠泽天下 尔我同行
4楼2012-03-01 12:58:26
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sk8er8irl

铁虫 (初入文坛)
刚刚这个问题得到了解答。现在想问大家有人用这个软件进行突变分析吗，怎么感觉突变后cartoon结构没有差异呢？
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2楼2012-02-29 17:17:11
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sk8er8irl

铁虫 (初入文坛)
求解答啊求解答~~~
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3楼2012-02-29 23:23:51
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sk8er8irl

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
楼: Originally posted by flyme8373 at 2012-03-01 12:58:26:
1.不知道楼主在进行突变处理后是否重新进行结构建模了？
2.如果更改的是一般的序列，那么细小的差别是不容易看到的，也很可能就没有差别
3.不知道楼主在进行突变处理后   结构建模用的是否为同源建模？如果是的 ...

恩，同源建模后没有太大差异我是了解的，这就是为什么 我原来用VMD1.9这个可视化软件 比较突变前后三维结构 发现没有差异 思考过的。
然后我听说PDB viewer这个软件自带mutation的分析，但不太会用，看到有些文献上有人用过，还比较了结构前后的变化。
针对第一个问题，想问下突变后的建模不用同源建模用什么可能能看到结构上的变化？谢谢回答。
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5楼2012-03-01 14:45:13
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