24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 979  |  回复: 10

huanghl2010

木虫 (著名写手)

[求助] DL_POLY报错,自由度太低

total degrees of freedom                         0.
rotational degrees of freedom                    0.
shell pseudo degrees of freedom                  0.
DL_POLY terminated due to error   350
error - too few degrees of freedom
以上是output的报错信息,
手册给的解释是:
Message 350: error - too few degrees of freedom
This error can arise if a small system is being simulated and the number of constraints applied is
too large.
Action:
Simulate a larger system or reduce the number of constraints.
这是要求我把盒子扩大吗?盒子大小和自由度有关系吗?求教。
回复此楼
MOFs
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

nightwalker

金虫 (著名写手)

  不太明白
奇文共欣赏,疑义相与析。
2楼2012-02-15 16:58:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

043114076

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
御剑江湖(金币+2): 谢谢 2012-02-17 21:40:02
是你把分子都固定了吧, 贴出field 文件看看
3楼2012-02-15 21:33:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

huanghl2010

木虫 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by nightwalker at 2012-02-15 16:58:09:
  不太明白

MOF_N3   14.007000    0.723000    1    1
  MOF_N3   14.007000    0.723000    1    1
  MOF_N3   14.007000    0.723000    1    1
finish
CH4
nummols         1
atoms      1    mass       charge    rept
     CH4_C    16.0430      0.0000     1
rigid 1
  1    1
finish
VDW   136
MOF_Zn    MOF_Zn    lj      0.23009     4.04000
MOF_Zn    MOF_N1    lj      0.27297     3.65000

CH4采用了单点模型,NVT,一个甲烷分子。这样不对吗?我没有固定CH4,但把MOF固定住了。
MOFs
4楼2012-02-15 21:54:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

huanghl2010

木虫 (著名写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 043114076 at 2012-02-15 21:33:41:
是你把分子都固定了吧, 贴出field 文件看看

MOF_N3   14.007000    0.723000    1    1
  MOF_N3   14.007000    0.723000    1    1
  MOF_N3   14.007000    0.723000    1    1
finish
CH4
nummols         1
atoms      1    mass       charge    rept
     CH4_C    16.0430      0.0000     1
rigid 1
  1    1
finish
VDW   136
MOF_Zn    MOF_Zn    lj      0.23009     4.04000
MOF_Zn    MOF_N1    lj      0.27297     3.65000

CH4采用了单点模型,NVT,一个甲烷分子。这样不对吗?我没有固定CH4,但把MOF固定住了。
MOFs
5楼2012-02-15 21:55:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

043114076

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

jiaoyixiong(金币+3): 鼓励交流 2012-02-16 00:18:40
一个甲烷分子太少了
6楼2012-02-15 22:03:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

huanghl2010

木虫 (著名写手)

引用回帖:
: Originally posted by 043114076 at 2012-02-15 22:03:43:
一个甲烷分子太少了

是太少,但这是特殊情况。就是要研究一个分子的情形啊
MOFs
7楼2012-02-15 22:10:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

043114076

木虫 (正式写手)

御剑江湖(金币+2): 谢谢 2012-02-17 21:40:22
引用回帖:
7楼: Originally posted by huanghl2010 at 2012-02-15 22:10:54:
是太少,但这是特殊情况。就是要研究一个分子的情形啊

什么意思, 一般不会用MM只研究一个小分子的体系
8楼2012-02-15 23:02:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

huanghl2010

木虫 (著名写手)

引用回帖:
8楼: Originally posted by 043114076 at 2012-02-15 23:02:09:
什么意思, 一般不会用MM只研究一个小分子的体系

我是研究甲烷在MOF材料中的扩散,MOF材料和沸石非常类似。CH4采用了一个分子,但MOF晶胞有上千个原子。
MOFs
9楼2012-02-16 08:19:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

043114076

木虫 (正式写手)

御剑江湖(金币+4): 谢谢 2012-02-17 21:40:30
引用回帖:
9楼: Originally posted by huanghl2010 at 2012-02-16 08:19:15:
我是研究甲烷在MOF材料中的扩散,MOF材料和沸石非常类似。CH4采用了一个分子,但MOF晶胞有上千个原子。

MOF原子是固定的不考虑
气体扩散,使用一个气体分子的模型肯定是不对的. 因为最后你分析数据是统计结果,所以模型比较大才有统计意义.
10楼2012-02-16 08:53:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 huanghl2010 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 322求调剂 +7 宋明欣 2026-03-27 7/350 2026-03-28 21:27 by sanrepian
[考研] 一志愿北化085600材料专硕275|有文章专利|求调剂 +7 Micky11223 2026-03-25 7/350 2026-03-28 18:34 by 无际的草原
[考研] 312,生物学求调剂 +3 小译同学abc 2026-03-28 3/150 2026-03-28 15:32 by 落睿可思
[考研] 0703本科郑州大学求调剂 +3 nhj_ 2026-03-25 3/150 2026-03-28 13:24 by Iveryant
[考研] 药学105500求调剂 +3 Ssun。。 2026-03-28 3/150 2026-03-28 11:24 by lxf170613
[考研] 0856,材料与化工321分求调剂 +12 大馋小子 2026-03-27 13/650 2026-03-28 10:56 by self2008
[考研] 0703化学求调剂,各位老师看看我!!! +5 祁祺祺 2026-03-25 5/250 2026-03-27 21:44 by 东方猪猪
[考研] 283求调剂(080500) +4 A child 2026-03-27 4/200 2026-03-27 15:34 by XPU李庆
[考研] 一志愿陕师大生物学071000,298分,求调剂 +5 SYA! 2026-03-23 5/250 2026-03-27 09:29 by 不吃魚的貓
[考研] 294分080500材料科学与工程求调剂 +4 柳溪边 2026-03-26 4/200 2026-03-26 21:14 by XPU李庆
[考研] 303求调剂 +6 蓝山月 2026-03-25 6/300 2026-03-25 22:47 by 418490947
[考研] 材料与化工304求B区调剂 +3 邱gl 2026-03-25 3/150 2026-03-25 19:03 by Ainin_
[考研] 各位老师您好:本人初试372分 +5 jj涌77 2026-03-25 6/300 2026-03-25 14:15 by mapenggao
[考研] 284求调剂 +15 Zhao anqi 2026-03-22 15/750 2026-03-25 12:51 by wht0531
[考研] 0854电子信息求调剂 324 +4 Promise-jyl 2026-03-23 4/200 2026-03-25 11:36 by Sugarlight
[考研] 289材料与化工(085600)B区求调剂 +4 这么名字咋样 2026-03-22 5/250 2026-03-25 08:20 by mx.yue
[考研] 求调剂 +6 研研,接电话 2026-03-24 7/350 2026-03-24 17:01 by barlinike
[考研] 材料考研调剂生 +3 黄粱一梦千年 2026-03-24 3/150 2026-03-24 17:00 by barlinike
[考研] 一志愿山东大学药学学硕求调剂 +3 开开心心没烦恼 2026-03-23 4/200 2026-03-24 00:06 by 开开心心没烦恼
[考研] 275求调剂 +6 shansx 2026-03-22 8/400 2026-03-22 15:27 by barlinike
信息提示
请填处理意见