应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » DL_POLY报错，自由度太低
111/2返回列表12下一页
查看: 1223  |  回复: 10
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

huanghl2010

木虫 (著名写手)

[求助] DL_POLY报错，自由度太低

total degrees of freedom                         0.
rotational degrees of freedom                    0.
shell pseudo degrees of freedom                  0.
DL_POLY terminated due to error   350
error - too few degrees of freedom
以上是output的报错信息，
手册给的解释是：
Message 350: error - too few degrees of freedom
This error can arise if a small system is being simulated and the number of constraints applied is
too large.
Action:
Simulate a larger system or reduce the number of constraints.
这是要求我把盒子扩大吗？盒子大小和自由度有关系吗？求教。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
MOFs
1楼 2012-02-15 16:44:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

nightwalker

金虫 (著名写手)
  不太明白
回复此楼
奇文共欣赏，疑义相与析。
2楼2012-02-15 16:58:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

043114076

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
御剑江湖(金币+2): 谢谢 2012-02-17 21:40:02
是你把分子都固定了吧, 贴出field 文件看看
赞一下 回复此楼
3楼2012-02-15 21:33:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

huanghl2010

木虫 (著名写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by nightwalker at 2012-02-15 16:58:09:
  不太明白

MOF_N3   14.007000    0.723000    1    1
  MOF_N3   14.007000    0.723000    1    1
  MOF_N3   14.007000    0.723000    1    1
finish
CH4
nummols         1
atoms      1    mass       charge    rept
     CH4_C    16.0430      0.0000     1
rigid 1
  1    1
finish
VDW   136
MOF_Zn    MOF_Zn    lj      0.23009     4.04000
MOF_Zn    MOF_N1    lj      0.27297     3.65000

CH4采用了单点模型，NVT，一个甲烷分子。这样不对吗？我没有固定CH4,但把MOF固定住了。
赞一下 回复此楼
MOFs
4楼2012-02-15 21:54:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

huanghl2010

木虫 (著名写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 043114076 at 2012-02-15 21:33:41:
是你把分子都固定了吧, 贴出field 文件看看

MOF_N3   14.007000    0.723000    1    1
  MOF_N3   14.007000    0.723000    1    1
  MOF_N3   14.007000    0.723000    1    1
finish
CH4
nummols         1
atoms      1    mass       charge    rept
     CH4_C    16.0430      0.0000     1
rigid 1
  1    1
finish
VDW   136
MOF_Zn    MOF_Zn    lj      0.23009     4.04000
MOF_Zn    MOF_N1    lj      0.27297     3.65000

CH4采用了单点模型，NVT，一个甲烷分子。这样不对吗？我没有固定CH4,但把MOF固定住了。
赞一下 回复此楼
MOFs
5楼2012-02-15 21:55:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

043114076

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

jiaoyixiong(金币+3): 鼓励交流 2012-02-16 00:18:40
一个甲烷分子太少了
赞一下 回复此楼
6楼2012-02-15 22:03:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

huanghl2010

木虫 (著名写手)
引用回帖:
楼: Originally posted by 043114076 at 2012-02-15 22:03:43:
一个甲烷分子太少了

是太少，但这是特殊情况。就是要研究一个分子的情形啊
赞一下 回复此楼
MOFs
7楼2012-02-15 22:10:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

043114076

木虫 (正式写手)
御剑江湖(金币+2): 谢谢 2012-02-17 21:40:22
引用回帖:
7楼: Originally posted by huanghl2010 at 2012-02-15 22:10:54:
是太少，但这是特殊情况。就是要研究一个分子的情形啊

什么意思, 一般不会用MM只研究一个小分子的体系
赞一下 回复此楼
8楼2012-02-15 23:02:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

huanghl2010

木虫 (著名写手)
引用回帖:
8楼: Originally posted by 043114076 at 2012-02-15 23:02:09:
什么意思, 一般不会用MM只研究一个小分子的体系

我是研究甲烷在MOF材料中的扩散，MOF材料和沸石非常类似。CH4采用了一个分子，但MOF晶胞有上千个原子。
赞一下 回复此楼
MOFs
9楼2012-02-16 08:19:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

043114076

木虫 (正式写手)
御剑江湖(金币+4): 谢谢 2012-02-17 21:40:30
引用回帖:
9楼: Originally posted by huanghl2010 at 2012-02-16 08:19:15:
我是研究甲烷在MOF材料中的扩散，MOF材料和沸石非常类似。CH4采用了一个分子，但MOF晶胞有上千个原子。

MOF原子是固定的不考虑
气体扩散,使用一个气体分子的模型肯定是不对的. 因为最后你分析数据是统计结果,所以模型比较大才有统计意义.
赞一下 回复此楼
10楼2012-02-16 08:53:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 huanghl2010 的主题更新
111/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 面上意见出来了 +9 黄鸟于飞Chao 2026-08-29 18/900 2026-08-30 16:47 by 黄鸟于飞Chao
[基金申请] 能否申诉？ +4 echo8914667 2026-08-30 4/200 2026-08-30 16:03 by sundiv
[基金申请] 有没有仍没收到信息的 +6 德尚中行 2026-08-27 7/350 2026-08-30 12:53 by Bxndjjd
[基金申请] 国社科又开始会评了，不知道这次命运如何 +3 雨打竹帘 2026-08-30 4/200 2026-08-30 12:35 by 白大多亮
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 8/400 2026-08-30 12:03 by l0VvVHGBGRLv
[论文投稿] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +5 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 7/350 2026-08-30 11:51 by l0VvVHGBGRLv
[找工作] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 9/450 2026-08-30 11:41 by l0VvVHGBGRLv
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +5 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 6/300 2026-08-30 11:07 by l0VvVHGBGRLv
[硕博家园] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +4 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 5/250 2026-08-30 06:55 by ZPa0EcMwuECS
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +6 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 10/500 2026-08-30 06:11 by ZPa0EcMwuECS
[考研] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +7 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 11/550 2026-08-30 05:40 by ZPa0EcMwuECS
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +5 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 6/300 2026-08-30 01:58 by ZPa0EcMwuECS
[公派出国] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 4/200 2026-08-30 01:45 by ZPa0EcMwuECS
[论文投稿] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +4 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 5/250 2026-08-30 01:03 by ZPa0EcMwuECS
[基金申请] 中青基了要发朋友圈吗？ +4 349506619 2026-08-28 4/200 2026-08-29 22:41 by alongwaytogo
[基金申请] 国社科申报系统有变化 +3 kynobel 2026-08-23 3/150 2026-08-29 21:57 by 余韵清
[基金申请] 国自然面上复盘~欢迎讨论 (金币+15) +15 晴天加油 2026-08-26 16/800 2026-08-29 18:28 by symmetry
[基金申请] 怎么查啊 +6 huang1991js 2026-08-26 6/300 2026-08-28 08:42 by winsaint
[文学芳草园] 梦想 +3 myrtle 2026-08-26 3/150 2026-08-27 10:01 by angelyueyi
[基金申请] 某些机构，以效率低为荣，以效率低作为存在感 +9 yuleib84 2026-08-25 10/500 2026-08-25 17:14 by alexon
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭