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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 存档旧帖 » 幼稚问题一个，在Genbank上查某基因，为何会出现两个mRNA，两个CDS区？
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sk8er8irl

铁虫 (初入文坛)

[交流] 幼稚问题一个，在Genbank上查某基因，为何会出现两个mRNA，两个CDS区？ 已有5人参与

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nucc ... 790&to=35251967

就是这个基因，上面出现了两个版本的mRNA:join(1..590,3550..5176)还有join(1122..1254,3550..5178)。但编码的都是GJB3啊，为啥会这样子呢？还有，问下，转录起始位点是1呢，还是1122呢？这个不太懂。CDS区是3575..4387的话，那1..590和1122..1254是CDS区的UTR区？不明白不明白，求解求解！~谢谢。
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1楼 2012-02-14 09:35:40
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ivxy

金虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
wanhscn(金币+2): 有道理！ 2012-02-14 16:50:29
我是这么认为的：
两种剪切方式
mRNA1:join(1..590,3550..5176)
mRNA2:join(1122..1254,3550..5178)
CDS都是：3575..4387；
也就是5‘非编码区不同
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4楼2012-02-14 11:22:42
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sk8er8irl

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
6楼: Originally posted by 春天放羊 at 2012-02-14 15:08:33:
如ls说的，是2个转录本，描叙里都写的transcrip variant 1和2

恩，对的。那为什么翻译出同一种蛋白（都是Connexin31)会有两种transcript variants呢？谢回答。

[ Last edited by sk8er8irl on 2012-2-14 at 15:12 ]
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7楼2012-02-14 15:11:23
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sk8er8irl

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
10楼: Originally posted by 春天放羊 at 2012-02-14 15:21:11:
同一个基因经过选择性剪接，可以有多个转录本，以及与转录本对应的多个蛋白，这样的基因还挺多的，选择性剪接是很普遍的现象，一般对于多个转录本和蛋白会标注1.2···之类的以示区分，但基因只有1个

哦，对了，one more question. 那转录起始位点是什么？
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12楼2012-02-14 15:31:09
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普通回帖

斯多格格

铜虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
有类似疑惑，帮顶一下
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书自香我何须花
2楼2012-02-14 10:05:38
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sk8er8irl

铁虫 (初入文坛)
求大侠解释！
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3楼2012-02-14 11:10:51
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晓风残月cl

新虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
应该是两个转录本吧
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5楼2012-02-14 12:51:47
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春天放羊

新虫 (初入文坛)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
如ls说的，是2个转录本，描叙里都写的transcrip variant 1和2
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6楼2012-02-14 15:08:33
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春天放羊

新虫 (初入文坛)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
同一个基因经过选择性剪接，可以有多个转录本，以及与转录本对应的多个蛋白，这样的基因还挺多的，选择性剪接是很普遍的现象，一般对于多个转录本和蛋白会标注1.2···之类的以示区分，但基因只有1个
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8楼2012-02-14 15:18:08
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春天放羊

新虫 (初入文坛)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
6楼: Originally posted by 春天放羊 at 2012-02-14 15:08:33:
如ls说的，是2个转录本，描叙里都写的transcrip variant 1和2

同一个基因经过选择性剪接，可以有多个转录本，以及与转录本对应的多个蛋白，这样的基因还挺多的，选择性剪接是很普遍的现象，一般对于多个转录本和蛋白会标注1.2···之类的以示区分，但基因只有1个
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9楼2012-02-14 15:20:15
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春天放羊

新虫 (初入文坛)
wanhscn(金币+2): 这个回答较靠谱！ 2012-02-14 16:48:33
wanhscn(金币+2, MolEPI+1): 根据虫友回复，授予专家指数一枚，欢迎常来指点！ 2012-02-14 16:49:32
引用回帖:
7楼: Originally posted by sk8er8irl at 2012-02-14 15:11:23:
恩，对的。那为什么翻译出同一种蛋白（都是Connexin31)会有两种transcript variants呢？谢回答。
[ Last edited by sk8er8irl on 2012-2-14 at 15:12 ]

同一个基因经过选择性剪接，可以有多个转录本，以及与转录本对应的多个蛋白，这样的基因还挺多的，选择性剪接是很普遍的现象，一般对于多个转录本和蛋白会标注1.2···之类的以示区分，但基因只有1个
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10楼2012-02-14 15:21:11
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