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sk8er8irl

铁虫 (初入文坛)

[交流] 幼稚问题一个,在Genbank上查某基因,为何会出现两个mRNA,两个CDS区? 已有5人参与

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nucc ... 790&to=35251967

就是这个基因,上面出现了两个版本的mRNA:join(1..590,3550..5176)还有join(1122..1254,3550..5178)。但编码的都是GJB3啊,为啥会这样子呢?还有,问下,转录起始位点是1呢,还是1122呢?这个不太懂。CDS区是3575..4387的话,那1..590和1122..1254是CDS区的UTR区?不明白不明白,求解求解!~谢谢。
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ivxy

金虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
wanhscn(金币+2): 有道理! 2012-02-14 16:50:29
我是这么认为的:
两种剪切方式
mRNA1:join(1..590,3550..5176)
mRNA2:join(1122..1254,3550..5178)
CDS都是:3575..4387;
也就是5‘非编码区不同
4楼2012-02-14 11:22:42
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sk8er8irl

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 春天放羊 at 2012-02-14 15:08:33:
如ls说的,是2个转录本,描叙里都写的transcrip variant 1和2

恩,对的。那为什么翻译出同一种蛋白(都是Connexin31)会有两种transcript variants呢?谢回答。

[ Last edited by sk8er8irl on 2012-2-14 at 15:12 ]
7楼2012-02-14 15:11:23
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sk8er8irl

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
10楼: Originally posted by 春天放羊 at 2012-02-14 15:21:11:
同一个基因经过选择性剪接,可以有多个转录本,以及与转录本对应的多个蛋白,这样的基因还挺多的,选择性剪接是很普遍的现象,一般对于多个转录本和蛋白会标注1.2···之类的以示区分,但基因只有1个

哦,对了,one more question. 那转录起始位点是什么?
12楼2012-02-14 15:31:09
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普通回帖

斯多格格

铜虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
有类似疑惑,帮顶一下
书自香我何须花
2楼2012-02-14 10:05:38
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sk8er8irl

铁虫 (初入文坛)

求大侠解释!
3楼2012-02-14 11:10:51
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晓风残月cl

新虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
应该是两个转录本吧
5楼2012-02-14 12:51:47
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春天放羊

新虫 (初入文坛)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
如ls说的,是2个转录本,描叙里都写的transcrip variant 1和2
6楼2012-02-14 15:08:33
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春天放羊

新虫 (初入文坛)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
同一个基因经过选择性剪接,可以有多个转录本,以及与转录本对应的多个蛋白,这样的基因还挺多的,选择性剪接是很普遍的现象,一般对于多个转录本和蛋白会标注1.2···之类的以示区分,但基因只有1个
8楼2012-02-14 15:18:08
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春天放羊

新虫 (初入文坛)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
6楼: Originally posted by 春天放羊 at 2012-02-14 15:08:33:
如ls说的,是2个转录本,描叙里都写的transcrip variant 1和2

同一个基因经过选择性剪接,可以有多个转录本,以及与转录本对应的多个蛋白,这样的基因还挺多的,选择性剪接是很普遍的现象,一般对于多个转录本和蛋白会标注1.2···之类的以示区分,但基因只有1个
9楼2012-02-14 15:20:15
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春天放羊

新虫 (初入文坛)

wanhscn(金币+2): 这个回答较靠谱! 2012-02-14 16:48:33
wanhscn(金币+2, MolEPI+1): 根据虫友回复,授予专家指数一枚,欢迎常来指点! 2012-02-14 16:49:32
引用回帖:
7楼: Originally posted by sk8er8irl at 2012-02-14 15:11:23:
恩,对的。那为什么翻译出同一种蛋白(都是Connexin31)会有两种transcript variants呢?谢回答。
[ Last edited by sk8er8irl on 2012-2-14 at 15:12 ]

同一个基因经过选择性剪接,可以有多个转录本,以及与转录本对应的多个蛋白,这样的基因还挺多的,选择性剪接是很普遍的现象,一般对于多个转录本和蛋白会标注1.2···之类的以示区分,但基因只有1个
10楼2012-02-14 15:21:11
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