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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » primer 5 设计引物的问题
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杜拉拉314159

铜虫 (初入文坛)

[求助] primer 5 设计引物的问题

我想利用primer 5设计引物，已知模板序列，1kb，然后我想从这上面p出一段200bp的片段，也是已知序列，要保证200bp全部扩增出来，是不是用1kb全长进行设计啊，但是我选择不到能完整扩增我那个200bp产物的引物，求助~！！！怎么设计引物才能扩增出那短序列呢？坐等回复，谢谢大家~！
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自己选择的路，跪着也要走完！
1楼 2012-02-12 16:42:11
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piaoyunokok

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
小丹木木(金币+2): 鼓励应助 2012-02-15 11:12:20
杜拉拉314159(金币+1): 2012-02-16 09:16:20
这个用200bp设计肯定是可以的，在两端就可以，下载的软件应该有使用说明的，如果你的没有，可以在网上下载一个。确实手动设计的比较好，自动生成的不一定是最好的，呵呵。看懂了其实挺简单的，相信自己
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14楼2012-02-13 19:27:13
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查看全部 17 个回答

lxj341401

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
1949stone(金币+1): 同意 2012-02-12 19:30:40
杜拉拉314159(金币+1): ★有帮助 2012-02-12 20:42:47
要扩展的200bp片段两端设计引物就好了。不用1kb的序列来设计，先把要扩展片段序列找出来。
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2楼2012-02-12 19:10:08
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cxl_yll

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
杜拉拉314159(金币+1): ★有帮助 2012-02-12 20:43:10
西瓜(金币+1): 鼓励应助 2012-02-12 22:10:54
以200bp设计引物就可以了，如何需要加酶切位点，根据实验需要记得加保护碱基哦~~ 妹妹 你是哪个学校啊
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3楼2012-02-12 19:32:42
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杜拉拉314159

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
楼: Originally posted by cxl_yll at 2012-02-12 19:32:42:
以200bp设计引物就可以了，如何需要加酶切位点，根据实验需要记得加保护碱基哦~~ 妹妹 你是哪个学校啊

谢谢前辈，弱弱的问一下，你QQ是多少啊？我还有很多问题呢，想问问你。。。
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自己选择的路，跪着也要走完！
4楼2012-02-12 20:34:05
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