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落雨辰砂

金虫 (小有名气)

[求助] 二苯并噻吩晶体模型

本人新手 需要为二苯并噻吩建模 但只查到以下数据 求高手指点帮忙查查它的各原子坐标.....如果能有该晶体cif文件 更是感激  小弟研究方向为DBT加氢脱硫 求同方向者交流指点...
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zhouli9728

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

嗯嗯嗯,我的和你的很像,我做的苯并噻吩的。直接用MS软件建立就可以了啊。还有,请问你的那些数据从哪里得到的?
新手新手,大家多多包含!!!!!!!!!!!!!!!
6楼2013-05-03 20:45:03
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查看全部 6 个回答

huanghl2010

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
jiaoyixiong(金币+5): 鼓励交流 2012-02-09 13:58:29
13264-95-4.mol
  ChemDraw07311017262D

13 15  0  0  0  0  0  0  0  0999 V2000
    0.4066   -0.3213    0.0000 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   -0.4066   -0.3213    0.0000 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
    0.6644    0.4542    0.0000 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
    0.9639   -0.9381    0.0000 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   -0.6584    0.4542    0.0000 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   -0.9599   -0.9381    0.0000 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   -0.0000    0.9381    0.0000 S   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
    1.4736    0.6267    0.0000 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
    1.7711   -0.7675    0.0000 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   -1.4696    0.6267    0.0000 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   -1.7711   -0.7675    0.0000 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
    2.0289    0.0158    0.0000 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   -2.0289    0.0158    0.0000 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  1  2  1  0      
  1  3  1  0      
  1  4  2  0      
  2  5  2  0      
  2  6  1  0      
  3  7  1  0      
  3  8  2  0      
  4  9  1  0      
  5 10  1  0      
  5  7  1  0      
  6 11  2  0      
  8 12  1  0      
  9 12  2  0      
10 13  2  0      
11 13  1  0      
M  END
MOFs
2楼2012-02-09 11:25:32
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huanghl2010

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
jiaoyixiong(金币+3): 鼓励交流 2012-02-09 14:40:00
落雨辰砂(金币+8): ★★★很有帮助 2012-02-10 15:14:40
将以上内容复制到写字板里,把文件扩展名改成.mol就行了。
http://www.chemicalbook.com/Sear ... 6%e5%99%bb%e5%90%a9
MOFs
3楼2012-02-09 11:27:06
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落雨辰砂

金虫 (小有名气)

引用回帖:
: Originally posted by huanghl2010 at 2012-02-09 11:25:32:
13264-95-4.mol
  ChemDraw07311017262D

13 15  0  0  0  0  0  0  0  0999 V2000
    0.4066   -0.3213    0.0000 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   -0.4066   -0.3213    0.0000 C   0  0  0  ...

谢谢你的答案  但我我所需要的是二苯并噻吩的晶体模型 需知道二苯并噻吩中个原子的坐标 向晶胞中填充原子...
4楼2012-02-10 15:26:29
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