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littlegao

金虫 (正式写手)

[求助] 二苯并噻吩对称分子 键级 为何不对称?

我用我算了一下二苯并噻吩(DBT)的键级...用的B3LYP/6-31+G*优化,用B3LYP/6-311+G**计算的...照着文献的方法....结果 C1-C2的键级 1.479 C10-C11是1.568~ 本来是对称分子,Chem3D  所有分子都一个平面上,空间位置也很对称,可结果不对称...不知道为何...

二苯并噻吩(DBT)
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lihb734

铁杆木虫 (职业作家)

站在计算化学入门的门槛上

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
littlegao: 金币+1 2012-04-20 20:12:36
具有C2V对称性?否则不同正常。
但也不会差得太多
前途光明,出路难觅!
2楼2012-04-20 17:16:42
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littlegao

金虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by lihb734 at 2012-04-20 17:16:42:
具有C2V对称性?否则不同正常。
但也不会差得太多

我很奇怪的就是 差得太多了...
而且优化结构以后...两者键长一样大... 可是键级居然差这么多~
3楼2012-04-20 20:12:31
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wanglixia001

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
zhou2009: 金币+3 2012-04-21 10:33:31
littlegao: 金币+4, ★★★很有帮助 2012-04-21 11:12:35
这个物质的C1-C2的键级 和 C10-C11的键级照你这种算法必然不一样。如果你想让他们一样的话,可以在计算的时候强制分子对称。在没有强制分子对称的情况下,左右两边的两个环最终是肯定不会在同一个平面上的,会产生一个很小的夹角(主要由于中间S原子的限制,否则夹角可能会达到几十度左右),这样就会导致C1-C2和 C10-C11所处的化学环境不一样,建级当然不一样。你上面的给出的图是平面的,其实你可以查看下两个环的空间夹角,便知结果。另,Chem3D只是初步的优化,不可以作为结果的,最终的结果要看的是高斯计算出来的结构。
做最好的自己!
4楼2012-04-21 10:17:02
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littlegao

金虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by wanglixia001 at 2012-04-21 10:17:02:
这个物质的C1-C2的键级 和 C10-C11的键级照你这种算法必然不一样。如果你想让他们一样的话,可以在计算的时候强制分子对称。在没有强制分子对称的情况下,左右两边的两个环最终是肯定不会在同一个平面上的,会产生 ...

谢谢回复啊。嗯,看了你的回复感觉明白了些。
另外能不能教教我 具体怎么强制对称啊...  初学者..确实很多地方不懂...需高人指点...
5楼2012-04-21 11:12:19
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wanglixia001

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
5楼: Originally posted by littlegao at 2012-04-21 11:12:19:
谢谢回复啊。嗯,看了你的回复感觉明白了些。
另外能不能教教我 具体怎么强制对称啊...  初学者..确实很多地方不懂...需高人指点...

在生成计算文件的时候,里面有个对称性选项,选择总是你想要的那个对称性就可以了。计算不熟的话可能要慢慢找。
做最好的自己!
6楼2012-04-21 11:30:53
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夏天的娃

金虫 (小有名气)

???????:
2?: Originally posted by lihb734 at 2012-04-20 17:16:42:
????C2V?????????????????
????????????

???加了C2V对称优化(GV设置了,G都写了pg=c2v),优化???的结构????了c2v,用这个结构??算NBO的时候还??加对称么?

我没有??NBO的时候加对称,得到的bond order基本是对称的,在对映???上的两个最大键级相差0.0005,???以认为还是个对称的???。。
7楼2012-04-21 16:57:49
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夏天的娃

金虫 (小有名气)

???????:
7?: Originally posted by ??????? at 2012-04-21 16:57:49:
???加了C2V对称优化(GV设置了,G都写了pg=c2v),优化???的结构????了c2v,用这个结构??算NBO的时候还??加对称么?

我没有??NBO的时候加对称,得到? ...

?䶮???????????????????
????????GV??????C2V???????G?????????pg=c2v??????????????c2v?????????????????????????????????????????????????
????????????????????????????????????С??0.001?????????????ɡ???
8楼2012-04-21 17:01:29
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