| 查看: 3402 | 回复: 5 | |||
zhangguangping木虫 (著名写手)
|
[求助]
PBS中资源的选择#PBS -l nodes=...
|
|
现在使用的是Torque 2.4.6+Maui 3.3.1 我对节点nodes文件的配置为： node01 np=12 sugon siesta dalton gaussian node02 np=12 sugon siesta dalton gaussian node03 np=12 sugon siesta dalton gaussian node04 np=12 sugon siesta dalton gaussian node05 np=12 sugon siesta dalton gaussian node06 np=12 sugon siesta dalton gaussian node07 np=12 sugon siesta dalton gaussian node08 np=12 sugon siesta dalton gaussian node09 np=12 sugon siesta dalton gaussian node10 np=12 sugon siesta dalton gaussian node11 np=12 sugon siesta dalton gaussian node12 np=12 sugon siesta dalton gaussian node31 np=8 powerlead siesta dalton gaussian others node32 np=8 powerlead siesta dalton gaussian others node33 np=8 powerlead siesta dalton gaussian others node34 np=8 powerlead siesta dalton gaussian others node35 np=8 powerlead siesta dalton gaussian others node36 np=8 powerlead siesta dalton gaussian others node38 np=8 powerlead siesta dalton gaussian others node39 np=8 powerlead siesta dalton gaussian others node40 np=8 powerlead siesta dalton gaussian others node41 np=8 dell siesta dalton gaussian others node42 np=8 dell siesta dalton gaussian others node43 np=8 dell siesta dalton gaussian others node44 np=8 dell molpro node45 np=8 dell molpro node46 np=8 dell molpro 提交任务的时候，如果在脚本里面写道： #PBS -l nodes=1:dell:ppn=8 表示任务需要在具有dell属性的节点上执行， 现在有一个想法：我现在有一个任务，想首先提交到sugon上执行，如果sugon满了，那么就提交到powerlead上执行，如果powerlead上满了，就往dell上提交。也就说这些资源对任务来说是有优先顺序的。请教一下这个该怎么实现？ |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 分子模拟 |
» 猜你喜欢
308求调剂
已经有4人回复
-
NSFC申报书里申请人简历中代表性论著还需要在申报书最后的附件里面再上传一遍吗
已经有14人回复
-
材料与化工一志愿南昌大学327求调剂推荐
已经有6人回复
-
化学调剂0703
已经有7人回复
-
327求调剂
已经有11人回复
-
调剂
已经有8人回复
-
梁成伟老师课题组欢迎你的加入
已经有7人回复
-
伙伴们，祝我生日快乐吧
已经有24人回复
-
中科院材料273求调剂
已经有3人回复
-
材料工程专硕274一志愿211求调剂
已经有5人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- pbs脚本可否提交新的pbs脚本任务？
已经有5人回复
- PBS 主服务无法启动
已经有8人回复
- PBS浓度能用到1M吗
已经有7人回复
- 如何编写PBS作业的脚本？
已经有14人回复
- 【课件】生物质基PBS（季君晖）
已经有40人回复
- 求助关于pbs缓冲溶液的配置
已经有10人回复
- 大肠杆菌在PBS之类的缓冲液中4度能保持活性多久啊
已经有7人回复
- gamess的pbs脚本！
已经有6人回复
- PBS溶液怎么除氧
已经有7人回复
- 【求助/交流】PBS和PBST
已经有6人回复
- 【交流】用PBS缓冲液测试后碰到的问题
已经有8人回复
- 【原创】并行平台构建与管理[10]：强行删除pbs作业方式
已经有5人回复
- 【求助】PB、PBS、PBST的区别
已经有9人回复
- 【转帖】PBS安装
已经有11人回复
cenwanglai
荣誉版主 (知名作家)
老和山猥琐派九段
- 1ST强帖: 5
- 应助: 46 (小学生)
- 贵宾: 8.842
- 金币: 7440.4
- 散金: 9654
- 红花: 118
- 沙发: 23
- 帖子: 5306
- 在线: 1961.4小时
- 虫号: 537452
- 注册: 2008-04-01
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
- 管辖: 仿真模拟
2楼2012-02-06 21:43:17
zhangguangping
木虫 (著名写手)
- 1ST强帖: 23
- 应助: 71 (初中生)
- 贵宾: 0.031
- 金币: 1973.1
- 散金: 9059
- 红花: 79
- 帖子: 2681
- 在线: 2128.8小时
- 虫号: 529624
- 注册: 2008-03-20
- 性别: GG
- 专业: 原子和分子物理
★
uuv2010(金币+1): 多谢提示 2012-02-07 10:01:28
uuv2010(金币+1): 多谢提示 2012-02-07 10:01:28
|
那个是我给每一个节点添加的额外属性，一个节点可以有不同的属性。这样用做别的用途。具体可以参见http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=4065399 |
3楼2012-02-06 21:45:10
bluewhale
铁杆木虫 (正式写手)
- 应助: 58 (初中生)
- 金币: 8438.3
- 散金: 50
- 红花: 10
- 帖子: 890
- 在线: 362.2小时
- 虫号: 278289
- 注册: 2006-09-10
- 专业: 凝聚态物性I:结构、力学和
4楼2012-02-07 09:49:47
zhangguangping
木虫 (著名写手)
- 1ST强帖: 23
- 应助: 71 (初中生)
- 贵宾: 0.031
- 金币: 1973.1
- 散金: 9059
- 红花: 79
- 帖子: 2681
- 在线: 2128.8小时
- 虫号: 529624
- 注册: 2008-03-20
- 性别: GG
- 专业: 原子和分子物理
|
你的意思是将不同分类的节点分别建立不同的队列，让这些节点分属于这些队列，然后再建立一个batch队列，这个队列里面包含上面建立的队列。提交任务的时候，指定队列使用-q batch,这样任务就会从batch里面队列里按照顺序搜索满足条件的空闲资源，一旦找到就提交上，并且不再往下面找了，是吗？ 另外，往batch里面添加队列使用什么关键字啊？我从手册上没有找到呢。能够详细点指教一下吗？ 还有一个问题，我现在已经对不同的账户建立了不同的队列，不同的账户只能用他们自己的队列提交任务，如果按照你说的方法，这样就不能用了。大家所有的用户需要用同一个队列，batch，具体的提交上的时候使用的队列是分配给资源所对应的队列，起不到不同用户使用不同队列的目的了。现在就是一个用户所使用的队列里里面有不同类型和速度的机器，想再提交任务的时候优先使用速度快的机器，这样节省资源。 |
5楼2012-02-07 10:18:27
bluewhale
铁杆木虫 (正式写手)
- 应助: 58 (初中生)
- 金币: 8438.3
- 散金: 50
- 红花: 10
- 帖子: 890
- 在线: 362.2小时
- 虫号: 278289
- 注册: 2006-09-10
- 专业: 凝聚态物性I:结构、力学和
【答案】应助回帖
★
zhangguangping(金币+5): ★★★很有帮助 谢谢！ 2012-02-07 23:35:42
liliangfang(金币+1): 多谢提示 2012-02-08 09:08:35
zhangguangping(金币+5): ★★★很有帮助 谢谢！ 2012-02-07 23:35:42
liliangfang(金币+1): 多谢提示 2012-02-08 09:08:35
|
没错，可以按如下类似操作： # # Create and define queue batch # create queue batch set queue batch queue_type = Route set queue batch resources_max.mem = 48gb set queue batch resources_min.mem = 16gb set queue batch route_destinations = X56q set queue batch route_destinations += quad54q set queue batch route_destinations += quad53q set queue batch enabled = True set queue batch started = True |
6楼2012-02-07 21:16:07
