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200618530201

金虫 (小有名气)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 1418.5
散金: 15
帖子: 125
在线: 25.3小时
虫号: 1063109
注册: 2010-07-23

[求助] 有没有人用Amber做过膜蛋白动力学模拟

请问有没有人用Amber做过膜蛋白的动力学模拟啊？我是新手，想请教一下，谢谢大家了！

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1楼2012-02-06 11:54:58

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

therotyonth

金虫 (正式写手)

应助: 9 (幼儿园)
金币: 2815.4
红花: 11
帖子: 951
在线: 68.9小时
虫号: 2349854
注册: 2013-03-15
专业: 理论和计算化学

引用回帖:

11楼: Originally posted by 小卷xujunli at 2013-09-09 13:59:31
你好，我现在也是用amber做膜蛋白，用charmm-gui加完膜了，但是加入立场时，老提示the file contained 859 atoms not in residue templates
想请问一下这是怎么回事儿？...

我用amber，不过不是做膜蛋白！你用的力场可以考虑换一下试试！