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zhangguangping

木虫 (著名写手)

[求助] 使用 AUG-cc-pV6Z基组计算,出现错误。

输入文件:
%Nprocs=12
%mem=10GB
%chk=C6H6O-diffuse-charged-aug-V6Z.chk
# B3LYP/Gen opt pop=full

diffuse basis for O

-1 1
C                 -1.85849048    0.22641509    0.00000000
C                 -0.46333048    0.22641509    0.00000000
C                  0.23420752    1.43416609    0.00000000
C                 -0.46344648    2.64267509   -0.00119900
C                 -1.85827148    2.64259709   -0.00167800
C                 -2.55587248    1.43439109   -0.00068200
H                 -2.40824948   -0.72590191    0.00045000
H                  0.08617752   -0.72609791    0.00131500
H                  0.08675352    3.59481809   -0.00125800
H                 -2.40839348    3.59487809   -0.00263100
H                 -3.65547648    1.43457409   -0.00086200
O                  1.66420727    1.43427012    0.00082444

C H 0
6-31G
****
O 0
AUG-cc-pV6Z
****

O 0
AUG-cc-pV6Z

计算到一个地方就出错结束了。不清楚是什么原因导致的。看了一下不是内存的问题,也不是磁盘空间的问题。请高手指教

出错信息:
forrtl: severe (174): SIGSEGV, segmentation fault occurred
Image              PC                Routine            Line        Source            
libpthread.so.0    00002B07B3848C00  Unknown               Unknown  Unknown
libpthread.so.0    00002B07B3848AAD  Unknown               Unknown  Unknown
l601.exe           00000000008AB872  Unknown               Unknown  Unknown
libpthread.so.0    00002B07B3841143  Unknown               Unknown  Unknown
libc.so.6          00002B07B3A148CD  Unknown               Unknown  Unknown

出错位置:
   ........
   247  (A)--V       31.18479  35.01120
     248  (A)--V       33.95025  43.16759
     249  (A)--V       33.95077  43.18851
     250  (A)--V       33.96475  43.18219
     251  (A)--V       34.07656  43.30313
     252  (A)--V       34.09767  43.34496
     253  (A)--V       98.11472 185.87558
Total kinetic energy from orbitals= 3.051806818568D+02

补充:使用AUG-cc-pV5Z正常计算,正常结束。

[ Last edited by zhangguangping on 2012-2-5 at 17:11 ]
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弘德明志博学笃行
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abbott

金虫 (著名写手)

不要用QQ问我东西

segmentation fault occurred
这个就是错误信息了。
Chemistry[]==[]Chem[]is[]try!!!
4楼2012-02-06 09:19:54
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nyzhaoyin

新虫 (正式写手)

错误信息在哪里?
2楼2012-02-06 01:10:08
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wzwanglab

至尊木虫 (职业作家)

皇帝

我是初学者,请教一下楼主,为什么C,H用那么小的基组,而O用这么大的基组?有什么说法吗?
3楼2012-02-06 05:04:31
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zhangguangping

木虫 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by nyzhaoyin at 2012-02-06 01:10:08:
错误信息在哪里?

计算到这个位置的时候
........
   247  (A)--V       31.18479  35.01120
     248  (A)--V       33.95025  43.16759
     249  (A)--V       33.95077  43.18851
     250  (A)--V       33.96475  43.18219
     251  (A)--V       34.07656  43.30313
     252  (A)--V       34.09767  43.34496
     253  (A)--V       98.11472 185.87558
Total kinetic energy from orbitals= 3.051806818568D+02
出来的错误是:
forrtl: severe (174): SIGSEGV, segmentation fault occurred
Image              PC                Routine            Line        Source            
libpthread.so.0    00002B07B3848C00  Unknown               Unknown  Unknown
libpthread.so.0    00002B07B3848AAD  Unknown               Unknown  Unknown
l601.exe           00000000008AB872  Unknown               Unknown  Unknown
libpthread.so.0    00002B07B3841143  Unknown               Unknown  Unknown
libc.so.6          00002B07B3A148CD  Unknown               Unknown  Unknown

这个错误不是在高斯的输出文件中,而是在PBS提交的脚本的标准错误文件中。
弘德明志博学笃行
5楼2012-02-06 09:25:45
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