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关于转录组RNA-Seq分析
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happyapplelj
新虫
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专业: 农业昆虫学
[
求助
]
关于转录组RNA-Seq分析
现在得到了不同处理的样品转录组数据,包括代谢通路分析,预测编码蛋白框和表达差异分析,刚接触这块,面对一堆数据,一头雾水,哪位高手能指教下。非常感谢
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1楼
2012-02-03 12:35:18
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hpzinc65
金虫
(小有名气)
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(幼儿园)
金币: 1408.5
帖子: 56
在线: 43.6小时
虫号: 1433734
注册: 2011-10-09
专业: 林木遗传育种学
【答案】应助回帖
你是自己做还是送公司?我的是送公司做的,他们给的差异基因标准是这个FDR≤0.001 AND |log2Ratio|≥1。我现在是把他们给的差异基因都找出来,挑选一些做荧光定量。我在pathway主要是看我的差异基因是在哪个节点的,是不是我重点关注的基因。
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12楼
2012-07-16 16:57:22
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happyapplelj
新虫
(初入文坛)
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(幼儿园)
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帖子: 13
在线: 1.8小时
虫号: 1596596
注册: 2012-02-02
专业: 农业昆虫学
新手没啥钱,麻烦高手帮忙
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2楼
2012-02-03 12:38:46
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ybj1983
至尊木虫
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帖子: 1612
在线: 234.1小时
虫号: 987078
注册: 2010-04-01
性别: GG
专业: 基因表达调控与表观遗传学
【答案】应助回帖
感谢参与,应助指数 +1
There's no other way besides reading references related to your research.
This is a gradual process. Do not worry about anyting, and just take your time. Good luck.
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学无止境
3楼
2012-02-03 18:09:35
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mky163
木虫
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红花: 1
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在线: 182.3小时
虫号: 1005523
注册: 2010-04-25
专业: 水产生物遗传育种学
【答案】应助回帖
感谢参与,应助指数 +1
现在这方面的文献有很多的,正如3楼所说。多看一下这方面的文献。既然是不同处理的样本转录组的话,比较起来应该会写出一些内容的。祝好运。
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长风破浪会有时,直挂云帆济沧海。
4楼
2012-02-03 19:41:05
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