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happyapplelj

新虫 (初入文坛)

[求助] 关于转录组RNA-Seq分析

现在得到了不同处理的样品转录组数据，包括代谢通路分析，预测编码蛋白框和表达差异分析，刚接触这块，面对一堆数据，一头雾水，哪位高手能指教下。非常感谢
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1楼2012-02-03 12:35:18
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

wanhscn

木虫 (职业作家)

哲学@草根

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
西瓜(金币+2): Good 2012-02-04 21:13:07
分析代谢通路 可以用 ricenet wormnet humannet 等等 看看那些是在同一个代谢通路内 参考这片seminar http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=4008798
上面还有关于表达数据分析的内容，可以看其引用文献。
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happyapplelj
真相是最大的奢侈品
5楼2012-02-03 20:02:23
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hpzinc65

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

主要看你具体想做哪一方面了，我也刚接触转录组，我们主要是想找差异基因，就是从pathway的图上看的，如果你也做这一方面，我们可以交流一下
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10楼2012-07-06 19:25:59
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sgs8725

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

刚接手too   你的测序结果里面可能会有一个readme  你根据里面的东西打开就能找到思路了   我为了能搞明白里面的东西  花4000块钱培训费来公司培训的
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15楼2012-11-22 09:22:20
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普通回帖

happyapplelj

新虫 (初入文坛)
新手没啥钱，麻烦高手帮忙
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2楼2012-02-03 12:38:46
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ybj1983

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
There's no other way besides reading references related to your research.
This is a gradual process. Do not worry about anyting, and just take your time. Good luck.
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学无止境
3楼2012-02-03 18:09:35
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mky163

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
现在这方面的文献有很多的，正如3楼所说。多看一下这方面的文献。既然是不同处理的样本转录组的话，比较起来应该会写出一些内容的。祝好运。
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长风破浪会有时，直挂云帆济沧海。
4楼2012-02-03 19:41:05
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happyapplelj

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
楼: Originally posted by ybj1983 at 2012-02-03 18:09:35:
There's no other way besides reading references related to your research.
This is a gradual process. Do not worry about anyting, and just take your time. Good luck.

谢谢
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6楼2012-02-04 20:48:33
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happyapplelj

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
楼: Originally posted by mky163 at 2012-02-03 19:41:05:
现在这方面的文献有很多的，正如3楼所说。多看一下这方面的文献。既然是不同处理的样本转录组的话，比较起来应该会写出一些内容的。祝好运。

谢谢
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7楼2012-02-04 20:49:04
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happyapplelj

新虫 (初入文坛)
送鲜花一朵
引用回帖:
楼: Originally posted by wanhscn at 2012-02-03 20:02:23:
分析代谢通路 可以用 ricenet wormnet humannet 等等 看看那些是在同一个代谢通路内 参考这片seminar http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=4008798
上面还有关于表达数据分析的内容，可以看其引 ...

谢谢
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8楼2012-02-04 20:49:32
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xiong1225

金虫 (初入文坛)
引用回帖:
8楼: Originally posted by happyapplelj at 2012-02-04 20:49:32:
谢谢

我也想问问得到了转录组的生物信息学分析的数据后，怎样才能比较得到一些价值的内容，真的只有靠查阅大量文献才能分析出来吗？？有没有高手可以指导一下呀
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9楼2012-03-04 18:08:47
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