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luxy

银虫 (小有名气)

引用回帖:
10楼: Originally posted by hpzinc65 at 2012-07-06 19:25:59
主要看你具体想做哪一方面了,我也刚接触转录组,我们主要是想找差异基因,就是从pathway的图上看的,如果你也做这一方面,我们可以交流一下

我也刚刚接触转录组,请问怎么从Pathway上看差异啊?差异基因的选择标准是什么?B to A RPKM ratio相差多少倍算是有差异
开题结束,问题多多,怎么办啊
11楼2012-07-16 13:35:20
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hpzinc65

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

你是自己做还是送公司?我的是送公司做的,他们给的差异基因标准是这个FDR≤0.001 AND |log2Ratio|≥1。我现在是把他们给的差异基因都找出来,挑选一些做荧光定量。我在pathway主要是看我的差异基因是在哪个节点的,是不是我重点关注的基因。
12楼2012-07-16 16:57:22
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luxy

银虫 (小有名气)

请问楼主,你是怎么处理测序样品的?每个处理几个个体?
开题结束,问题多多,怎么办啊
13楼2012-07-18 19:29:23
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justrightnow

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

我建了一个生物信息学理论与实践的QQ群,群号码:234803011 欢迎广大对生物信息学和系统生物学感兴趣的朋友加入交流,共享资源!
一心一意持续镇定关注
14楼2012-11-21 23:18:27
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sgs8725

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

刚接手too   你的测序结果里面可能会有一个readme  你根据里面的东西打开就能找到思路了   我为了能搞明白里面的东西  花4000块钱培训费来公司培训的
15楼2012-11-22 09:22:20
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cbiology

铜虫 (正式写手)

我也想知道
我要努力
16楼2014-09-02 22:37:32
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xuzhilan

铁虫 (小有名气)

上周才拿到数据,也完全不知道该干啥!!
孤独的牧羊人
17楼2015-05-18 20:17:26
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xieyuxiang80

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
17楼: Originally posted by xuzhilan at 2015-05-18 20:17:26
上周才拿到数据,也完全不知道该干啥!!

你的数据分析了吗?刚接触,一头雾水
努力做好每一件事
18楼2015-08-15 20:48:04
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