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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 关于转录组RNA-Seq分析
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luxy

银虫 (小有名气)
引用回帖:
10楼: Originally posted by hpzinc65 at 2012-07-06 19:25:59
主要看你具体想做哪一方面了，我也刚接触转录组，我们主要是想找差异基因，就是从pathway的图上看的，如果你也做这一方面，我们可以交流一下

我也刚刚接触转录组，请问怎么从Pathway上看差异啊？差异基因的选择标准是什么？B to A RPKM ratio相差多少倍算是有差异
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开题结束，问题多多，怎么办啊
11楼2012-07-16 13:35:20
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hpzinc65

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

你是自己做还是送公司？我的是送公司做的，他们给的差异基因标准是这个FDR≤0.001 AND |log2Ratio|≥1。我现在是把他们给的差异基因都找出来，挑选一些做荧光定量。我在pathway主要是看我的差异基因是在哪个节点的，是不是我重点关注的基因。
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12楼2012-07-16 16:57:22
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luxy

银虫 (小有名气)
请问楼主，你是怎么处理测序样品的？每个处理几个个体？
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开题结束，问题多多，怎么办啊
13楼2012-07-18 19:29:23
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justrightnow

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

我建了一个生物信息学理论与实践的QQ群，群号码：234803011 欢迎广大对生物信息学和系统生物学感兴趣的朋友加入交流，共享资源！
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一心一意持续镇定关注
14楼2012-11-21 23:18:27
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sgs8725

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

刚接手too   你的测序结果里面可能会有一个readme  你根据里面的东西打开就能找到思路了   我为了能搞明白里面的东西  花4000块钱培训费来公司培训的
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15楼2012-11-22 09:22:20
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cbiology

铜虫 (正式写手)
我也想知道
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我要努力
16楼2014-09-02 22:37:32
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xuzhilan

铁虫 (小有名气)
上周才拿到数据，也完全不知道该干啥！！
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孤独的牧羊人
17楼2015-05-18 20:17:26
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xieyuxiang80

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
17楼: Originally posted by xuzhilan at 2015-05-18 20:17:26
上周才拿到数据，也完全不知道该干啥！！

你的数据分析了吗？刚接触，一头雾水
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努力做好每一件事
18楼2015-08-15 20:48:04
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