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happyapplelj

新虫 (初入文坛)

[求助] 关于转录组RNA-Seq分析

现在得到了不同处理的样品转录组数据,包括代谢通路分析,预测编码蛋白框和表达差异分析,刚接触这块,面对一堆数据,一头雾水,哪位高手能指教下。非常感谢
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luxy

银虫 (小有名气)

引用回帖:
10楼: Originally posted by hpzinc65 at 2012-07-06 19:25:59
主要看你具体想做哪一方面了,我也刚接触转录组,我们主要是想找差异基因,就是从pathway的图上看的,如果你也做这一方面,我们可以交流一下

我也刚刚接触转录组,请问怎么从Pathway上看差异啊?差异基因的选择标准是什么?B to A RPKM ratio相差多少倍算是有差异
开题结束,问题多多,怎么办啊
11楼2012-07-16 13:35:20
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luxy

银虫 (小有名气)

请问楼主,你是怎么处理测序样品的?每个处理几个个体?
开题结束,问题多多,怎么办啊
13楼2012-07-18 19:29:23
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