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slay3

铜虫 (初入文坛)

[求助] 卟啉 收敛难

各位大侠,我想请教两个问题,
1.我在进行两个卟啉呈垂直位置的优化过程中难收敛,其中输出文件有四个收敛标准,
Item               Value     Threshold  Converged?
Maximum Force            0.000953     0.000450     NO
RMS     Force            0.000089     0.000300     YES
Maximum Displacement     0.028641     0.001800     NO
RMS     Displacement     0.004679     0.001200     NO
可见第二个标准已经达到,但其他三个标准在下面的计算中离标准越来越远,请问如何调整?

2.我在进行两个卟啉呈一定夹角计算时(所呈夹角为55度)优化也难收敛,且到后面两个卟啉趋于错位平行,因为平行的模型我单独做过优化,想请问如何才能使卟啉呈夹角的优化收敛。

以下是输入文件(坐标处没写):
%mem=1024MB
%nprocl=4
%nproc=1
#p opt m062x/cc-pvtz

Molecule Name

0 1
坐标处没写
请各位大侠赐教(附图为垂直模型和夹角模型)



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gujing136

禁虫 (文坛精英)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
磊哥,你这把这些都放在网上啊,降低收敛标准就好了,这网上你都可以搜索到的。
叫老猫的兔子
2楼2012-02-02 14:21:14
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gujing136

禁虫 (文坛精英)

【答案】应助回帖

slay3(金币+5): 有帮助 2012-02-07 10:53:18
还有就是基组太大了,这些都是方法··
叫老猫的兔子
3楼2012-02-02 14:22:19
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slay3

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
: Originally posted by gujing136 at 2012-02-02 14:22:19:
还有就是基组太大了,这些都是方法··

哈哈,你在啊,降低标准我试过了啊,到底要降低多少才行
4楼2012-02-02 14:41:51
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zhou2009

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
为什么不考虑两个卟啉面对面地平行放置,而让红色原子分别在上方和下方呢?优化后,两个卟啉趋于错位平行,红色原子分别在上方和下方。

二体叶绿素就是错位平行,上下再有原子或分子作用的。
5楼2012-02-03 09:46:29
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slay3

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
: Originally posted by zhou2009 at 2012-02-03 09:46:29:
为什么不考虑两个卟啉面对面地平行放置,而让红色原子分别在上方和下方呢?优化后,两个卟啉趋于错位平行,红色原子分别在上方和下方。

二体叶绿素就是错位平行,上下再有原子或分子作用的。

我的红色原子是虚原子,不起作用的,面对面的我优化过了,现在目的就是想优化呈夹角的,和呈垂直的,但是优化过程中离收敛标准越来越远,不知该怎么办,请版主赐教
6楼2012-02-03 11:30:18
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sheskybird

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
建议先用半经验优化一下  然后再加大机组吧
虚心学习
7楼2012-02-03 15:27:29
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zhou2009

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

slay3(金币+15): ★★★很有帮助 2012-02-07 10:52:59
这说明在一对一的情况下,本就是错位面对面的,当然呈夹角的和呈垂直的不收敛。

[ Last edited by zhou2009 on 2012-2-3 at 15:33 ]
8楼2012-02-03 15:32:03
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slay3

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
: Originally posted by zhou2009 at 2012-02-03 15:32:03:
这说明在一对一的情况下,本就是错位面对面的,当然呈夹角的和呈垂直的不收敛。
[ Last edited by zhou2009 on 2012-2-3 at 15:33 ]

但是晶体结构中是存在两个卟啉呈夹角的堆积的,所以才这样设计的,想优化看看结果,但是却趋于错位面对面了,这说明什么呢?
9楼2012-02-03 16:35:45
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slay3

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
: Originally posted by sheskybird at 2012-02-03 15:27:29:
建议先用半经验优化一下  然后再加大机组吧

你好,请问用半经验优化的目的是什么??谢谢
10楼2012-02-03 16:37:03
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