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lbambool

木虫 (著名写手)


[资源] 随文献下载的文本格式晶体结构导入到MS的一种方法

今天查文献时下载了三个文本格式的晶体结构文件,尝试多种方法试图导入到MS中一直不成功,多次尝试后发现,这个文本文件可用Diamond打开并存成cif文件,这个cif文件可以导入到MS里,但其中数据会缺失一部分,结构不完整。网上搜索发现也有人说diamond导出的cif不能使用,尝试导出成其他格式也不能直接导入到MS里。后来想起机上装有CCDC,因发文章的作者多半会把结构数据发给CCDC,于是尝试用CCDC组件来处理。
1.先用Diamond打开并存成cif文件;
2.打开Mercury,用它再打开刚才的cif文件,可以看到与用CCDC显示的结果相同,再用Mercury保存成cif文件;
3.用MS导入最后用mercury保存的cif文件可以完美显示晶体结构。

今天整整一个晚上都用来做这件事,小木虫上也查到有人问同样的问题,便把方法整理记录下来,以便网友共享。
应网友要求,加上主要步骤图片,不过较多,放在一个文件里了,需要的自己下载一下吧,一个一个的贴太麻烦了,见谅。[ Last edited by lbambool on 2012-1-29 at 22:45 ]
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lbambool

木虫 (著名写手)


引用回帖:
21楼: Originally posted by 建军 at 2012-03-23 16:24:52:
辛苦了~我是个菜鸟,刚进入这一领域,请问Diamond 和 Mercury、CCDC都是ICSD里的?还是别的软件啊??

这个问题百度 一下会更快些,学习要有自动性,不能什么都依靠别人,要尽可能自己解决问题。
23楼2012-03-23 19:55:56
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zhangliang8

木虫 (正式写手)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

谢谢楼主分享经验!~
2楼2012-01-29 08:53:40
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pbdp

铁虫 (小有名气)


★★★ 三星级,支持鼓励

多谢!
3楼2012-01-29 10:10:18
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wo_cow

木虫 (小有名气)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

神人呐!!!!!!!!1
8楼2012-02-23 16:44:58
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建军

银虫 (正式写手)


辛苦了~我是个菜鸟,刚进入这一领域,请问Diamond 和 Mercury、CCDC都是ICSD里的?还是别的软件啊??
21楼2012-03-23 16:24:52
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youzhiren

木虫 (小有名气)


可能是MS不支持中文目录的缘故,我之前也碰到过类似情况,把文件复制到英文目录就正常了。
36楼2012-05-23 00:48:18
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yalefield4楼
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xuhu_115楼
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vasp0019楼
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huangll9911楼
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truemantwo12楼
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天欲蓝13楼
2012-02-29 18:52   回复  
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chenchu15楼
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smswt17楼
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2012-03-22 14:04   回复  
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2012-03-22 18:17   回复  
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建军20楼
2012-03-23 16:23   回复  
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37113199022楼
2012-03-23 18:46   回复  
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xyhu24楼
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hugoxia26楼
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haoziok28楼
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