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yaowenzhi

铜虫 (小有名气)

[求助] 求助一个简单的脚本

在服务器上算结构,不想单个算,想可以有个小程序,使交在服务器的任务可以自动挨个算完,记得在以前的实验室,有个老师自己写的脚本,说很简单,只可惜我自己是一点都不懂,所以想请教高手帮忙写一个,我也好学习学习。
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yoghurt117

木虫 (正式写手)

用什么软件算啊

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I am 废Man! 把握住每一刻才是最重要的!
2楼2012-01-27 20:21:01
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yaowenzhi

铜虫 (小有名气)

送鲜花一朵
引用回帖:
: Originally posted by yoghurt117 at 2012-01-27 20:21:01:
用什么软件算啊

用gaussian算的
3楼2012-01-28 15:54:10
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yoghurt117

木虫 (正式写手)

我不知道你的gauss的目录和分子的目录,写得有点麻烦,你憋足了耐心看啊,我只知道这个笨办法,不知道其他人还有没有更好的办法
---------------------------------------------------------
比如,你的主目录名字是yaowenzhi,而gauss的主目录g03在这之下(/home/yaowenzhi/g03),你的分子文件在mol目录下(比如/home/yaowenzhi/mol),假设你的分子文件名分别为
test1.com, test2.com,......

先给高斯设置命令链接,这个有点类似于windows的快捷方式,有两个办法
第一个笨办法,在终端下运行,
(I) cd /home/yaowenzhi/mol
(II) ln -s /home/yaowenzhi/g03/g03
这样子在/home/yaowenzhi/mol目录下就有一个g03的链接了

或者用第二个办法
(I)打开你的/home/yaowenzhi/目录下的.bashrc文件,添加“alias g03=/home/yaowenzhi/g03/g03”
(II)在终端下运行, cd /home/yaowenzhi ,接着运行source .bashrc
这样子你在终端中,在任何目录下直接敲入g03就可以运行高斯了,比第一种方法好,建议你用这个

然后在你的分子文件目录/home/yaowenzhi/mol目录下建一个文本文件,随便起个名字,比如yao,在文件中添加下列内容:
g03  test1.com > test1.log
g03  test2.com > test2.log
......
完了保存,接下来你需要赋予这个文件可执行的属性,在终端下运行
chmod +x yao
就可以了,然后在终端,进入/home/yaowenzhi/mol目录,直接敲入"./yao"就可以批处理了。

如果你用的 ln -s /home/yaowenzhi/g03/g03建的超链接,那么yao文件中的“g03”要改成“./g03”。

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I am 废Man! 把握住每一刻才是最重要的!
4楼2012-01-28 23:22:46
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yaowenzhi

铜虫 (小有名气)

送鲜花一朵
引用回帖:
: Originally posted by yoghurt117 at 2012-01-28 23:22:46:
我不知道你的gauss的目录和分子的目录,写得有点麻烦,你憋足了耐心看啊,我只知道这个笨办法,不知道其他人还有没有更好的办法
---------------------------------------------------------
比如,你的主目录名 ...

太感谢了,第二种方法真的很好,我采用了,谢谢
5楼2012-01-29 16:36:37
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