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annpc5

银虫 (小有名气)

[求助] 求高手指点关于2D图谱点的鉴定如何解释

求助:请教高手,如图所示,2D结果跑出来的蛋白质点 相同的分子量的点 , 挖点用二级质谱鉴定后,比对数据库结果显示,好几个平行的点对应的相同的蛋白质,如 4,5,6,和1,2,3, 以及 15,16,17分别对应蛋白质 A,B,和C。请问结果可信吗?可能是什么原因?
是否分子量相同,等电点不同,意味着 同一个蛋白质有异构体什么的造成的?

2D图谱局部



[ Last edited by annpc5 on 2012-1-18 at 21:37 ]
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annpc5

银虫 (小有名气)

送鲜花一朵
引用回帖:
: Originally posted by xueshuhan at 2012-01-19 07:27:39:
结果可以相信,15,16,17 可以看做是一个蛋白,之所以会出现不同等点的原因可能是你载入的蛋白过多,或是你在准备过程中的一些操作引起的。

那4,5,6或者1,2,3呢?分得比较开,看起来是不同的点,所以才拿去一一鉴定,结果指向同一个蛋白,也是因为这样吗?是不是质谱的结果很难作为最后结果?真正需要确定还是测序更靠谱?
3楼2012-01-19 09:52:17
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查看全部 7 个回答

xueshuhan

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
西瓜(金币+1): 鼓励应助 2012-01-19 19:33:41
annpc5: 金币+10, ★★★很有帮助 2012-03-22 14:45:22
结果可以相信,15,16,17 可以看做是一个蛋白,之所以会出现不同等点的原因可能是你载入的蛋白过多,或是你在准备过程中的一些操作引起的。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

2楼2012-01-19 07:27:39
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xueshuhan

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
西瓜(金币+2): Good! 2012-01-20 14:11:56
质谱测出来是一个蛋白那就应该是一个蛋白,质谱是可以信赖的。2D图谱一般都会出现你这种情况,即相同分子量不同的pI(等电点)值。
4楼2012-01-19 23:24:20
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chainchen

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
西瓜(金币+2): 鼓励交流 2012-02-04 21:13:33
annpc5: 金币+10, ★★★很有帮助 2012-03-22 14:45:47
完全可能。蛋白在体内存在修饰状态,同一个蛋白被磷酸化修饰后就会改变PI,分子量变化却不显著,因此也就出现同一蛋白呈多点分布。
5楼2012-02-04 21:09:35
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