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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 求高手指点关于2D图谱点的鉴定如何解释
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annpc5

银虫 (小有名气)

[求助] 求高手指点关于2D图谱点的鉴定如何解释

求助：请教高手，如图所示，2D结果跑出来的蛋白质点 相同的分子量的点 ， 挖点用二级质谱鉴定后，比对数据库结果显示，好几个平行的点对应的相同的蛋白质，如 4,5,6，和1,2,3， 以及 15,16,17分别对应蛋白质 A，B，和C。请问结果可信吗？可能是什么原因？
是否分子量相同，等电点不同，意味着 同一个蛋白质有异构体什么的造成的？

2D图谱局部



[ Last edited by annpc5 on 2012-1-18 at 21:37 ]
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1楼 2012-01-18 21:35:35
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xueshuhan

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
西瓜(金币+1): 鼓励应助 2012-01-19 19:33:41
annpc5: 金币+10, ★★★很有帮助 2012-03-22 14:45:22
结果可以相信，15,16,17 可以看做是一个蛋白，之所以会出现不同等点的原因可能是你载入的蛋白过多，或是你在准备过程中的一些操作引起的。
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» 本帖已获得的红花（最新10朵）

annpc5
2楼2012-01-19 07:27:39
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annpc5

银虫 (小有名气)
送鲜花一朵
引用回帖:
楼: Originally posted by xueshuhan at 2012-01-19 07:27:39:
结果可以相信，15,16,17 可以看做是一个蛋白，之所以会出现不同等点的原因可能是你载入的蛋白过多，或是你在准备过程中的一些操作引起的。

那4,5,6或者1,2,3呢？分得比较开，看起来是不同的点，所以才拿去一一鉴定，结果指向同一个蛋白，也是因为这样吗？是不是质谱的结果很难作为最后结果？真正需要确定还是测序更靠谱？
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3楼2012-01-19 09:52:17
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xueshuhan

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
西瓜(金币+2): Good！ 2012-01-20 14:11:56
质谱测出来是一个蛋白那就应该是一个蛋白，质谱是可以信赖的。2D图谱一般都会出现你这种情况，即相同分子量不同的pI（等电点）值。
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4楼2012-01-19 23:24:20
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chainchen

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
西瓜(金币+2): 鼓励交流 2012-02-04 21:13:33
annpc5: 金币+10, ★★★很有帮助 2012-03-22 14:45:47
完全可能。蛋白在体内存在修饰状态，同一个蛋白被磷酸化修饰后就会改变PI，分子量变化却不显著，因此也就出现同一蛋白呈多点分布。
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5楼2012-02-04 21:09:35
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Rubisco580

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
小丹木木(金币+2): 鼓励应助，多多交流哦 2012-02-06 15:14:57
annpc5: 金币+10, ★★★很有帮助 2012-03-22 14:46:03
质谱的可信程度看分值，但一般经过WB确认才能下结论。像这种分子量相同的蛋白串是可能的，楼上几位说的没错，经糖基化等修饰后分子量改变不大，等电点变化较大，所以出现这种现象。
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6楼2012-02-06 14:27:26
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annpc5

银虫 (小有名气)
谢谢大家，因答案都差不多，所以，额，微表心意，请各位吃一颗糖^_^
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7楼2012-03-22 14:46:56
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