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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 综合其他 » 细菌多样性，构建系统进化树中如何选择outgroup？急！！！！！！！
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huanghaiyu

金虫 (小有名气)
找一篇类似的文章看一下就可以    一般是同一个科的不同属作为外群    如果属比较大也可以用同一属的距离较远的菌株为外群
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11楼2012-01-16 16:14:41
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凌-强

银虫 (小有名气)
★
zhang8826857(金币+1): 鼓励交流 2012-02-09 19:58:07
请教了做过这种外群的，自己做了个，交给微生物学报通过了，说明我理解正确了。

外群就是指的是在你构树中，你的序列属于某几个群，那么你选择的这个外群只要不是你的这几个群就可以了，同时构建出来之后，这个外群最好是要成独立的一支，那么你就成功了。
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12楼2012-02-09 15:52:25
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加内特

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
做过系统进化树，是不是需要相似系数然后区分？
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少壮不努力，老大徒伤悲！
13楼2012-02-09 18:11:29
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sunlblove

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

看了几篇文献，弄清楚什么是OUTGTOUP了，但是关于如何选择的问题，个人觉得去决定于你的目的，如果是为了说明你的物种的进化关系，可以适当的选择与其不在一起进化的物种比如 做鲍鱼可以选择哺乳类或者鸟类
如果单纯为了你的图好看，有这么一栏外群，可以随便选吧  我觉得  欢迎吐槽 哈哈
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14楼2012-02-10 15:45:03
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wangyanlinx

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

请问楼主现在知道怎么选择外群了吧 可否指点一下啊  我也是做细菌16sRNA的， 拿到很多菌株，测序后都是一样的，然后NCBI后找到了百分百的同种菌，然后想根据这个建一个系统发育树，可是不知道怎么选外群，而且目前没有外群的树支持率不高，什么原因呢？
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15楼2012-10-07 22:56:09
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彤毋戚

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
12楼: Originally posted by 凌-强 at 2012-02-09 15:52:25
请教了做过这种外群的，自己做了个，交给微生物学报通过了，说明我理解正确了。

外群就是指的是在你构树中，你的序列属于某几个群，那么你选择的这个外群只要不是你的这几个群就可以了，同时构建出来之后，这个外 ...

请问你是怎么选外群的？我正在构建系统发育树，没搞懂
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16楼2015-01-25 10:35:02
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