应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 综合其他 » 细菌多样性，构建系统进化树中如何选择outgroup？急！！！！！！！
162/2返回列表上一页12
查看: 7270  |  回复: 15
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

huanghaiyu

金虫 (小有名气)
找一篇类似的文章看一下就可以    一般是同一个科的不同属作为外群    如果属比较大也可以用同一属的距离较远的菌株为外群
赞一下 回复此楼
11楼2012-01-16 16:14:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

凌-强

银虫 (小有名气)
★
zhang8826857(金币+1): 鼓励交流 2012-02-09 19:58:07
请教了做过这种外群的，自己做了个，交给微生物学报通过了，说明我理解正确了。

外群就是指的是在你构树中，你的序列属于某几个群，那么你选择的这个外群只要不是你的这几个群就可以了，同时构建出来之后，这个外群最好是要成独立的一支，那么你就成功了。
赞一下(4人) 回复此楼
12楼2012-02-09 15:52:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

加内特

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
做过系统进化树，是不是需要相似系数然后区分？
赞一下 回复此楼
少壮不努力，老大徒伤悲！
13楼2012-02-09 18:11:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sunlblove

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

看了几篇文献，弄清楚什么是OUTGTOUP了，但是关于如何选择的问题，个人觉得去决定于你的目的，如果是为了说明你的物种的进化关系，可以适当的选择与其不在一起进化的物种比如 做鲍鱼可以选择哺乳类或者鸟类
如果单纯为了你的图好看，有这么一栏外群，可以随便选吧  我觉得  欢迎吐槽 哈哈
赞一下 回复此楼
14楼2012-02-10 15:45:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wangyanlinx

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

请问楼主现在知道怎么选择外群了吧 可否指点一下啊  我也是做细菌16sRNA的， 拿到很多菌株，测序后都是一样的，然后NCBI后找到了百分百的同种菌，然后想根据这个建一个系统发育树，可是不知道怎么选外群，而且目前没有外群的树支持率不高，什么原因呢？
赞一下 回复此楼
15楼2012-10-07 22:56:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

彤毋戚

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
12楼: Originally posted by 凌-强 at 2012-02-09 15:52:25
请教了做过这种外群的，自己做了个，交给微生物学报通过了，说明我理解正确了。

外群就是指的是在你构树中，你的序列属于某几个群，那么你选择的这个外群只要不是你的这几个群就可以了，同时构建出来之后，这个外 ...

请问你是怎么选外群的？我正在构建系统发育树，没搞懂
赞一下 回复此楼
16楼2015-01-25 10:35:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 凌-强 的主题更新
162/2返回列表上一页12
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +4 ZYXdhzDAy9ZX 2026-09-28 4/200 2026-09-29 16:54 by yCO1Ll7aHtsw
[考博] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 ZYXdhzDAy9ZX 2026-09-28 4/200 2026-09-29 16:47 by yCO1Ll7aHtsw
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 ZYXdhzDAy9ZX 2026-09-28 4/200 2026-09-29 16:37 by etmYJ6d2rquH
[硕博家园] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 ZYXdhzDAy9ZX 2026-09-28 3/150 2026-09-29 16:03 by etmYJ6d2rquH
[论文投稿] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 tqUTOxClQUMF 2026-09-28 4/200 2026-09-29 15:15 by etmYJ6d2rquH
[博后之家] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 tqUTOxClQUMF 2026-09-28 3/150 2026-09-29 15:04 by etmYJ6d2rquH
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 tqUTOxClQUMF 2026-09-28 3/150 2026-09-29 14:58 by etmYJ6d2rquH
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +6 GDBe8tDZqE8z 2026-09-28 6/300 2026-09-29 14:41 by etmYJ6d2rquH
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 CfXuS1rDhLYN 2026-09-28 3/150 2026-09-29 14:24 by etmYJ6d2rquH
[博后之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +6 IDs3scOF0tjC 2026-09-28 7/350 2026-09-29 14:07 by etmYJ6d2rquH
[公派出国] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 IDs3scOF0tjC 2026-09-28 5/250 2026-09-29 13:50 by etmYJ6d2rquH
[教师之家] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 GDBe8tDZqE8z 2026-09-28 4/200 2026-09-29 09:49 by JzYBbHIXWSrW
[找工作] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 ZYXdhzDAy9ZX 2026-09-28 3/150 2026-09-29 06:28 by ZvyPK8n6Nfki
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 tqUTOxClQUMF 2026-09-28 3/150 2026-09-28 23:46 by b8fCuTHqckEt
[考研] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 GDBe8tDZqE8z 2026-09-28 3/150 2026-09-28 23:12 by b8fCuTHqckEt
[公派出国] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +4 IDs3scOF0tjC 2026-09-28 4/200 2026-09-28 22:55 by ez6fGg9abYaj
[有机交流] 同一个分子，一条来自文献，一条来自AI——不告诉你答案，你会选哪条？ +3 tianxiaoxian 2026-09-28 6/300 2026-09-28 22:44 by tianxiaoxian
[找工作] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 IDs3scOF0tjC 2026-09-28 5/250 2026-09-28 22:32 by ez6fGg9abYaj
[论文投稿] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 CfXuS1rDhLYN 2026-09-28 3/150 2026-09-28 19:08 by 9lS3ad5oOymn
[考研] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 IDs3scOF0tjC 2026-09-28 4/200 2026-09-28 18:51 by 9lS3ad5oOymn
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭