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dxjdmy

木虫 (正式写手)

[求助] NBO分析求助

小虫想请教与NBO相关的几个 问题,望大虾提供帮助,谢谢
1、用NB03.1进行NBO分析时,我想求Cr-Cr的键级,结果如下:

Wiberg bond index matrix in the NAO basis:                                    

     Atom    1       2       3       4       5       6       7       8       9
     ---- ------  ------  ------  ------  ------  ------  ------  ------  ------
   1. Cr  0.0000  1.2548  0.7388  0.1990  0.8038  0.0798  0.1054  0.0112  0.0703
   2. Cr  1.2548  0.0000  0.1599  0.7153  0.1238  0.9458  0.0508  0.0025  0.1178
这是矩阵,但是下面有一个总的
Wiberg bond index, Totals by atom:                                            

     Atom    1
     ---- ------
   1. Cr  5.7579
   2. Cr  5.8196
接着下面还有一个NAO bond order

Atom-atom overlap-weighted NAO bond order:                                    

     Atom    1       2       3       4       5       6       7       8       9
     ---- ------  ------  ------  ------  ------  ------  ------  ------  ------
   1. Cr  0.0000  0.8210  0.6598  0.1777  0.7056  0.0758  0.0098  0.0092 -0.0074
   2. Cr  0.8210  0.0000  0.0819  0.6396  0.1208  0.7436  0.0024  0.0014  0.0248
Atom-atom overlap-weighted NAO bond order, Totals by atom:                    

     Atom    1
     ---- ------
   1. Cr  3.7968
   2. Cr  3.7606

接着下面还有一个矩阵:
MO bond order:                                                               

     Atom    1       2       3       4       5       6       7       8       9
     ---- ------  ------  ------  ------  ------  ------  ------  ------  ------
   1. Cr  0.0000 -0.0612  0.4004 -0.2270  0.0568 -0.1499  0.2370 -0.0294  0.1786
   2. Cr -0.0612  0.0000  0.1090  0.1352 -0.1210  0.0589 -0.0299  0.0500 -0.0819

①、总共三种键级,到底选哪一种比较好?②比如,如果选择NAO bond order,到底选择矩阵中对角线的数值还是选择total by atoms中相应原子后面的那个数值??③为什么wiberg bond order、NAO bond order、MO bond order三个数值差别这么大,MO bond order 的键级甚至已经到负值了??
2、在文献上看到进行NRT分析时,得到的Natural Bond Order矩阵中,所得的键级并不是整数,而我用GenNBO5.0W进行NRT分析时得到的Natural Bond Order矩阵中,所得的键级都是整数,是什么原因呀???
请各位大侠帮忙,万分感谢!
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tiechong

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

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感谢参与,应助指数 +1
zhou2009:编辑内容 2012-01-06 08:50
zhou2009(金币+2): 2012-01-06 08:51:05
wiberg bond order、NAO bond order都行, MO bond order 就不要用了, 很不靠谱。

[ Last edited by zhou2009 on 2012-1-6 at 08:50 ]
2楼2012-01-06 00:17:22
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