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dxbddpc

金虫 (小有名气)

[求助] checkCIF遇见的A类错误。帮忙解决一下啊!

Alert level A
SHFSU01_ALERT_2_A  The absolute value of parameter shift to su ratio > 0.20
            Absolute value of the parameter shift to su ratio given   2.092
            Additional refinement cycles may be required.
SYMMG02_ALERT_1_A        The _symmetry_equiv_pos_as_xyz values are inconsistent
                     with the H-M symbol given
           From the CIF: _symmetry_equiv_pos_as_xyz
                                             x, y, z
                                             x, -y, z+1/2
                                             x+1/2, y+1/2, z
                                             x+1/2, -y+1/2, z+1/2
           These symops generate the Hall space group symbol   c_-2yc
           From the CIF: _symmetry_space_group_name_H-M     c2
           From the xyz: _symmetry_space_group_name_H-M     c_1_c_1
PLAT080_ALERT_2_A Maximum Shift/Error ............................       2.09      
PLAT213_ALERT_2_A Atom N1              has ADP max/min Ratio .....       18.8 oblat
PLAT213_ALERT_2_A Atom N5              has ADP max/min Ratio .....        5.7 prola
PLAT214_ALERT_2_A Atom O6      (Anion/Solvent) ADP max/min Ratio          6.2 prola
PLAT222_ALERT_3_A Large Non-Solvent    H    Uiso(max)/Uiso(min) ..       10.0 Ratio
--------------------------------------------------------------------------------
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Giji521

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
huangjr(金币+1): 感谢应助~ 2011-12-30 21:13:18
木瓜少爷(金币+1): 鼓励回帖交流~ 2011-12-30 22:45:54
木瓜少爷: 回帖置顶 2011-12-30 22:45:56
PLAT080_ALERT_2_A Maximum Shift/Error ............................ 2.09
修正轮数不够多 Maximum Shift/Error 值应该接近于0,至少要在0.02 以下。
解决方法:增加修正轮数(L.S. 后的数值改大)
PLAT213_ALERT_2_A Atom N1              has ADP max/min Ratio .....       18.8 oblat
PLAT213_ALERT_2_A Atom N5              has ADP max/min Ratio .....        5.7 prola
N1,N5原子定错了或者是无序处理
PLAT214_ALERT_2_A Atom O6      (Anion/Solvent) ADP max/min Ratio          6.2 prola
考虑是否无序处理
PLAT222_ALERT_3_A Large Non-Solvent    H    Uiso(max)/Uiso(min) ..       10.0 Ratio
用hfix命令,将大的ueq值的H减小就可以了!

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

2楼2011-12-30 20:15:30
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dxbddpc

金虫 (小有名气)

送鲜花一朵
引用回帖:
楼: Originally posted by Giji521 at 2011-12-30 20:15:30:
PLAT080_ALERT_2_A Maximum Shift/Error ............................ 2.09
修正轮数不够多 Maximum Shift/Error 值应该接近于0,至少要在0.02 以下。
解决方法:增加修正轮数(L.S. 后的数值改大)
PLAT213_ ...

N1,N5原子定错了或者是无序处理,这个是要拆分吗?
用hfix命令,从哪看那个H的ueq比较大呢。还是对全部的H全部Hfix?
3楼2012-01-02 14:37:39
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