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wangyufang868

金虫 (小有名气)

[求助] A类错误如何解决?

SYMMG02_ALERT_1_A        The _symmetry_equiv_pos_as_xyz values are inconsistent
                     with the H-M symbol given
           From the CIF: _symmetry_equiv_pos_as_xyz
                                             x, y, z
                                             -x, y+1/2, -z+1/2
                                             -x, -y, -z
                                             x, -y-1/2, z-1/2
           These symops generate the Hall space group symbol   -p_2ybc
           From the CIF: _symmetry_space_group_name_H-M     pc
           From the xyz: _symmetry_space_group_name_H-M     p_1_21/c_1
                     ALERT     4 symops in cif,     2 symops generated
PLAT029_ALERT_3_A _diffrn_measured_fraction_theta_full Low .......      0.923      
PLAT306_ALERT_2_A Isolated Oxygen Atom (H-atoms Missing ?) .......         O4     
PLAT316_ALERT_2_A Too many H on C in C=N Moiety in Main Residue ..        C10
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gohappy

铜虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
解晶体的空间群有问题,建议用专业软件platon 检查,其可能正确的空间群
2楼2011-12-26 21:59:47
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soso800120

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
第一个是不是空间群搞错了??严重!!
PLAT029_ALERT_3_A _diffrn_measured_fraction_theta_full Low .......      0.923
数据本身原因 在ins中加入
acta 50 然后refine看看      
PLAT306_ALERT_2_A Isolated Oxygen Atom (H-atoms Missing ?) .......         O4     
如果是游离水问题不大 数据好的话可以看看周围有没有可能是H的残峰
PLAT316_ALERT_2_A Too many H on C in C=N Moiety in Main Residue ..        C10
这个问题比较严重 仔细看看C10上出了什么问题
3楼2011-12-30 01:23:21
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deng2011

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
PLAT029_ALERT_3_A _diffrn_measured_fraction_theta_full Low .......      0.923      
PLAT306_ALERT_2_A Isolated Oxygen Atom (H-atoms Missing ?) .......         O4     
PLAT316_ALERT_2_A Too many H on C in C=N Moiety in Main Residue ..        C10

第一个,PLAton,改下空间群
第二个,完整度太低,试下 OMIT 0  50
第三个,O4没加氢
第四个,C10上的H有问题,可以改下占有率~
4楼2011-12-30 10:18:02
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njyc

木虫 (正式写手)

过客

引用回帖:
3楼: Originally posted by soso800120 at 2011-12-30 01:23:21
第一个是不是空间群搞错了??严重!!
PLAT029_ALERT_3_A _diffrn_measured_fraction_theta_full Low .......      0.923
数据本身原因 在ins中加入
acta 50 然后refine看看      
PLAT306_ALERT_2_A Isolated ...

请问第一个怎么改空间群啊?
灯泡
5楼2013-01-22 22:46:15
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