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频率与结构能量最低点的关系
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各位: 请问,怎么寻找分子的稳定的几何形态(极小值).我先用AUTODOCK软件,将客体分子和主体分子进行自动对接,然后选择其中能量最低的前几个构型,先用PM3法进行几个优化,然后再频率计算。 本来,我的设想是只有极小值中频率计算,才会全是实频。其他的非极小值应该会出现虚频。但是结果,频率算出来后,用GaussView中的results中的vip看发现,全都不存在虚频。请问,这是怎么会事呢?这样的话,我又应该怎么寻找分子的稳定的几何形态呢?谢谢。 [ Last edited by 可米kemi on 2011-12-25 at 18:41 ] |
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beefly
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4楼2011-12-27 22:40:02
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