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频率与结构能量最低点的关系
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各位： 请问，怎么寻找分子的稳定的几何形态(极小值).我先用AUTODOCK软件，将客体分子和主体分子进行自动对接，然后选择其中能量最低的前几个构型，先用PM3法进行几个优化，然后再频率计算。 本来，我的设想是只有极小值中频率计算，才会全是实频。其他的非极小值应该会出现虚频。但是结果，频率算出来后，用GaussView中的results中的vip看发现，全都不存在虚频。请问，这是怎么会事呢？这样的话，我又应该怎么寻找分子的稳定的几何形态呢？谢谢。 [ Last edited by 可米kemi on 2011-12-25 at 18:41 ] |
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