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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 存档旧帖 » 序列拼接
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dreamshaker

铜虫 (正式写手)

[求助] 序列拼接

各位大虾，最近在做点生物信息学方面的东西，有不少的疑问啊。用DNAstar拼接了几个序列，为什么consensus里面出现非碱基（如W、S、K等），我也晓得它们是几个序列碱基不一致所导致的，可是这个软件用这些字母代替矛盾碱基就不懂了，怎样解释这些字母呢？后面还需要用到这个consensus，那这样的序列（含非碱基字母）能够用来比对吗，如果可以比对可信度大吗？
请各位大虾不惜赐教啊！
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踏踏实实，体会科研的乐趣
1楼 2011-12-24 19:58:40
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lxj341401

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
dreamshaker(金币+5): 2011-12-24 22:12:03
西瓜(金币+2): Good! 2011-12-25 15:38:11
R＝A／G，Y＝C／T，M＝A／C，K＝G／T，S＝C／G，W＝ A／T，H＝ A／C／T，B＝ C／G／T，V＝A／C／G， D＝A/G /T,N=A／C／G／T
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2楼2011-12-24 21:06:54
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dreamshaker

铜虫 (正式写手)
引用回帖:
楼: Originally posted by lxj341401 at 2011-12-24 21:06:54:
R＝A／G，Y＝C／T，M＝A／C，K＝G／T，S＝C／G，W＝ A／T，H＝ A／C／T，B＝ C／G／T，V＝A／C／G， D＝A/G /T,N=A／C／G／T

哇，很全啊，谢谢！
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踏踏实实，体会科研的乐趣
3楼2011-12-24 22:11:59
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