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dreamshaker

铜虫 (正式写手)

[求助] 序列拼接

各位大虾,最近在做点生物信息学方面的东西,有不少的疑问啊。用DNAstar拼接了几个序列,为什么consensus里面出现非碱基(如W、S、K等),我也晓得它们是几个序列碱基不一致所导致的,可是这个软件用这些字母代替矛盾碱基就不懂了,怎样解释这些字母呢?后面还需要用到这个consensus,那这样的序列(含非碱基字母)能够用来比对吗,如果可以比对可信度大吗?
请各位大虾不惜赐教啊!
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lxj341401

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
dreamshaker(金币+5): 2011-12-24 22:12:03
西瓜(金币+2): Good! 2011-12-25 15:38:11
R=A/G,Y=C/T,M=A/C,K=G/T,S=C/G,W= A/T,H= A/C/T,B= C/G/T,V=A/C/G, D=A/G /T,N=A/C/G/T
2楼2011-12-24 21:06:54
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dreamshaker

铜虫 (正式写手)

引用回帖:
: Originally posted by lxj341401 at 2011-12-24 21:06:54:
R=A/G,Y=C/T,M=A/C,K=G/T,S=C/G,W= A/T,H= A/C/T,B= C/G/T,V=A/C/G, D=A/G /T,N=A/C/G/T

哇,很全啊,谢谢!
踏踏实实,体会科研的乐趣
3楼2011-12-24 22:11:59
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