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moonbear

铁虫 (小有名气)

[求助] 紧急求助xi2004老师

xi2004老师,您好!本人新手,投Acta-E,审稿人意见如下:
You need to move two independent solvent molecules
into new positions, where they will show O7---H7C...O6 and O6---H6A...O3
hydrogen bonds WITHOUT any symmetry codes (i.e. ALL three  moieties
will be really positioned in one asymmetric part).
To do it, you have to transform the atomic coordinates of all atoms for each
solvent molecule using proper symmetry operation.
After such re-positioning, prepare new Fig. 1 without H-atoms except only two -
draw atoms H6A and H7C involved in hydrogen-bonding.
Show H...O hydrogen-bonding by dashed lines. Draw displacement
ellipsoids with 30% probability.
Use the following Legend:
"The content of asymmetric part of the tile compound showing the
atomic numbering and 30% probabilty displacement ellipsoids.
H atoms not inlvolved in hydrogen-bonding (dashed lines)
omitted for clarity."
第一次作图审稿人不满意,通过邮件请教他,给出如下建议:
Use the following transformations:
1. For the the molecule with O6, C34 & C33 and attached H atoms,
change atomic coordinates from (x, y, z) to (x-1, y, z).
1. For the the molecule with O7, C36 & C35 and attached H atoms,
change atomic coordinates from (x, y, z) to (1-x, 2-y, 1-z).
后请人作图(见附件)
审稿人回复:
The current Fig. 1 shows the whole unit cell (but NOT an asymmetric part).
Draw dsiplacement ellipsoids for all non-H atoms.
目前稿件被撤回,再投又回到原审稿人.紧急求助,万分感谢!
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  • 附件 1 : Fig2.tif
  • 2011-12-24 19:19:10, 9.77 K

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xi2004

至尊木虫 (职业作家)

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lichun1210(金币+40): 受楼主委托,给Xi2004老师金币 2011-12-27 23:29:38
lichun1210(金币+40): 受楼主委托,给Xi2004老师金币 2011-12-27 23:29:51
你要我做什么?
数据可发到我的 e-mai , 可帮你看看。
不过我不画图。
如着急, 看看谁先帮帮吧?
xi2004-emuch@163.com
2楼2011-12-24 22:38:01
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
lijunjie84(金币+5): 谢谢热心的xi老师,这节假日的!呵呵 2011-12-25 14:44:49
做了修改,已经发给你了。
实际还有些问题,编辑没提,先这样。
你要把原来投稿的一些内容移动过来。
图大致如附件。

做的修改如下
1. 按编辑的要求移动了溶剂分子。 另外 y 坐标整体做了 -0.5的移动。
  AFIx 33 改成 afix 137  
  加了氢键
然后重新修正
2. CIF中填了 moiety,加了吸收校正的文献。
3. 按编辑的要求试画了椭球图, 但没有把氢键画出来,你请人照着画, 或自己把氢键用photoshop添加。

潜在问题如下,编辑没提见算了
1. 溶剂可以处理成统计,因为椭球太大
2. 一些alert c其实是要解决的。
xi2004-emuch@163.com
3楼2011-12-25 13:09:06
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lqingh506

铁杆木虫 (知名作家)

Xi老师过节也来给人帮忙了,膜拜!
4楼2011-12-26 08:07:49
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天晴8986

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by xi2004 at 2011-12-24 22:38:01:
你要我做什么?
数据可发到我的 e-mai , 可帮你看看。
不过我不画图。
如着急, 看看谁先帮帮吧?

xi2004老师,你好,我刚接触到分析晶面,很多地方不懂,找了好多资料还是解决不了问题,想请教一下您,不知道您是否可以帮忙。我需要对材料的衍射光斑进行标定,可是我求出R1,R2,R3后,他们的比值我查表格后找不到相对应的值,不知道如何进行下去,敬请指教。如需要我可以把图,和数据都发给您,多谢了
5楼2011-12-26 13:55:28
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天晴8986

新虫 (小有名气)

我求过两种一种是θ=60,R2:R1=1.0638;R3:R2=1.0528查表格没有对应的值。另一种是θ=90,R2:R1=1.6551;R3:R2=1.9862查询表格也是没有相应的值,所以现在确定不了他的晶面到底改如何标定,请求xi2004老师的帮助,同时也请求各路高手指点,多谢
6楼2011-12-26 14:04:45
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天晴8986

新虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 天晴8986 at 2011-12-26 13:55:28:
xi2004老师,你好,我刚接触到分析晶面,很多地方不懂,找了好多资料还是解决不了问题,想请教一下您,不知道您是否可以帮忙。我需要对材料的衍射光斑进行标定,可是我求出R1,R2,R3后,他们的比值我查表格后找 ...

请求帮忙啊,多谢!

光斑

7楼2011-12-26 14:06:04
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天晴8986

新虫 (小有名气)

相机常数是24.8256,不知道是不是还需要其他数据
8楼2011-12-26 14:17:05
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wanghaichang

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by xi2004 at 2011-12-24 22:38:01:
你要我做什么?
数据可发到我的 e-mai , 可帮你看看。
不过我不画图。
如着急, 看看谁先帮帮吧?

xi2004您好,
有一个B错误,杂志就不收。 Ngt/Npar << 10,这个问题好解决吗
9楼2011-12-27 00:38:33
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)

引用回帖:
9楼: Originally posted by wanghaichang at 2011-12-27 00:38:33:
xi2004您好,
有一个B错误,杂志就不收。 Ngt/Npar << 10,这个问题好解决吗

你现在用来精修的数据角度最高到多少了?
可以试试 omit -2 52或 omit -2 50
当然,不知道你具体情况,蛮说一下
xi2004-emuch@163.com
10楼2011-12-27 08:10:37
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