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Li Na K Zn 金属有机化合物能否用6-31G 基组?
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苏远亭
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Li Na K Zn 金属有机化合物能否用6-31G 基组?
化合物晶体结构已测得,采用6-31G基组优化结构后,计算结果基本接近,但采用文献中经常使用的更高精度的基组计算后,结构却有较大偏差。试问对于Li Na K Zn金属有机化合物可否使用B3LYP-6-31G 来计算?非常感谢!!
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2011-12-23 10:57:20
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输入结构是直接从单晶结构来的,并去掉部分大的取代基简化来的
这两点就是问题,首先,看方法对不对,是绝对不能从单晶结构拿来做输入文件的。你必须自己弄一个输入文件。 去掉取代基这个地方也是有问题的,取代基虽然很多时候不影响性质,例如C8可以用C1来代替。但是取代基很多时候对构型的影响是很大的。 还有一点,单分子和多聚体的构型在很多时候显然是差别很大的。当形成晶体时,monomer在其他monomer的作用下(比如氢键,π作用等)分子基团会发生形变,这种形变一般和分子的柔性,以及分子间作用力大小有关。
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我想做个科学家,可我又喜欢写诗;我想做一个诗人,可我却读的理工科..
5楼
2011-12-23 14:35:15
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苏远亭(金币+30):
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很有帮助 2011-12-23 14:24:29
ben_ladeng: 2011-12-24 21:02:19
计算结果基本接近是什么意思呢? 你的初始输入结构是什么呢?
是直接从单晶结构来的?你的结构优化时单分子还是多聚体?
个人反正绝对6-31G 对于K Zn是不合适的
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我想做个科学家,可我又喜欢写诗;我想做一个诗人,可我却读的理工科..
2楼
2011-12-23 11:24:37
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2楼
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Originally posted by
jiewei
at 2011-12-23 11:24:37:
计算结果基本接近是什么意思呢? 你的初始输入结构是什么呢?
是直接从单晶结构来的?你的结构优化时单分子还是多聚体?
个人反正绝对6-31G 对于K Zn是不合适的
个人觉得,打错字了。。
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我想做个科学家,可我又喜欢写诗;我想做一个诗人,可我却读的理工科..
3楼
2011-12-23 11:25:03
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楼
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Originally posted by
jiewei
at 2011-12-23 11:24:37:
计算结果基本接近是什么意思呢? 你的初始输入结构是什么呢?
是直接从单晶结构来的?你的结构优化时单分子还是多聚体?
个人反正绝对6-31G 对于K Zn是不合适的
结果接近是指键长键角与单晶结构很相近,输入结构是直接从单晶结构来的,并去掉部分大的取代基简化来的,结构优化时是单分子,这和单体或多聚体有何关系?还请高人指点,非常感谢!!
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4楼
2011-12-23 14:24:14
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