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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 与别的菌相比，弧菌做PFGE时，为什么要加一种酶（NotⅠ或SfilⅠ）
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达菲鸭

新虫 (初入文坛)

[求助] 与别的菌相比，弧菌做PFGE时，为什么要加一种酶（NotⅠ或SfilⅠ）

老板让我做弧菌的PFGE（脉冲场凝胶电泳），我便查了一些相关的protocol。与之前师姐做过的沙门菌的PFGE相比，网上给出的弧菌的plug制作步骤里，多了一步限制性酶切，一般都是NotⅠ或SfilⅠ。从总体上看，我师姐之前做的plug步骤简单多了。虽然照着protocol做也可以，但我还是很想了解一下为什么。

BTW，网上说加入限制酶是为了比较不同菌的restriction sites的图谱，从而判断细菌的基因相关性。可我的这个实验不需要比较呀，而且我师姐之前做的沙门也没加任何限制性内切酶，这也是我比较confused的原因之一。

拜托各位大侠相助呀！先谢谢啦
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1楼 2011-12-22 10:33:41
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达菲鸭

新虫 (初入文坛)
自己顶一下
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2楼2011-12-25 16:54:11
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guoyanbiao

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

楼主，脉冲场凝胶电泳可以分离出2.3M ，1.8M以及2M之间的基因组条带吗？
是这样的，我的目的菌种含有无法分离的杂菌，我想通过脉冲场凝胶电泳，能分离开2.3M ，1.8M以及2M之间的基因组条带吗？我想通过脉冲场凝胶电泳，电泳前不酶切，分离开杂菌的基因组，切回目的基因的胶回收，做16S鉴定
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survive and succeed!!!!!!!!
3楼2013-04-18 16:59:25
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