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wntc

木虫 (正式写手)

[求助] 这个图是用哪个软件做出来的

谢谢!

electrostatic surface potentials mapped onto a surface of total electron density for TET (left) and PFT (right). Regions of higher
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zhou2009

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
wntc(金币+6): 谢谢!我试试看 2011-12-13 14:11:25
ben_ladeng(金币+2): 2011-12-14 07:33:57
Sobereva在以前回答这个问题时说:

“你给出的这个图是用Molekel 4.x版本做的。务必要注意,Molekel自己生成的静电势数据是通过Mulliken原子电荷计算的,这样的静电势在很多情况下哪怕连定性正确都说不上(因此很多用了Molekel做静电势图的文章里的数据是没意义的)。关于Molekel做静电势图的问题,稍后我会在我的blog里写个文章单独谈谈。

分子内部区域静电势主要由原子核电荷所主导,是很大的正值,实际上这些区域的静电势没什么意义。在Multiwfn里,数值超过最大上限的区域会显示为白色。
如果用等值线方式来绘制这张图,就会看到分子内部区域的静电势会显示出来。”

同时又说:

“Multiwfn里面不支持这种填色等值面图。gv、chemcraft、vmd等等都可以将一个格点文件(静电势数据)投影到另一个格点文件(电子密度)的等值面上。但是色彩刻度都是连续的,不支持这种离散的方式。色彩刻度条自行用photoshop贴到图中合适的位置并标上数值即可。”
4楼2011-12-13 08:58:01
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lihb734

铁杆木虫 (职业作家)

站在计算化学入门的门槛上

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
wntc(金币+3): 2011-12-13 14:12:15
ben_ladeng(金币+2): 专家考核存档 2011-12-14 07:33:38
显然是molekela啊
前途光明,出路难觅!
3楼2011-12-13 08:06:28
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sobereva

至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫


★ ★
zhou2009(金币+2): 2011-12-13 17:32:16
作图方法和相关讨论见此文
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=3451419
5楼2011-12-13 13:36:11
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