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wntc木虫 (正式写手)
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[求助]
这个图是用哪个软件做出来的
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谢谢！ electrostatic surface potentials mapped onto a surface of total electron density for TET (left) and PFT (right). Regions of higher |
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lihb734
铁杆木虫 (职业作家)
站在计算化学入门的门槛上
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3楼2011-12-13 08:06:28
zhou2009
版主 (著名写手)
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【答案】应助回帖
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感谢参与，应助指数 +1
wntc(金币+6): 谢谢！我试试看 2011-12-13 14:11:25
ben_ladeng(金币+2): 2011-12-14 07:33:57
感谢参与，应助指数 +1
wntc(金币+6): 谢谢！我试试看 2011-12-13 14:11:25
ben_ladeng(金币+2): 2011-12-14 07:33:57
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Sobereva在以前回答这个问题时说： “你给出的这个图是用Molekel 4.x版本做的。务必要注意，Molekel自己生成的静电势数据是通过Mulliken原子电荷计算的，这样的静电势在很多情况下哪怕连定性正确都说不上（因此很多用了Molekel做静电势图的文章里的数据是没意义的）。关于Molekel做静电势图的问题，稍后我会在我的blog里写个文章单独谈谈。 分子内部区域静电势主要由原子核电荷所主导，是很大的正值，实际上这些区域的静电势没什么意义。在Multiwfn里，数值超过最大上限的区域会显示为白色。 如果用等值线方式来绘制这张图，就会看到分子内部区域的静电势会显示出来。” 同时又说： “Multiwfn里面不支持这种填色等值面图。gv、chemcraft、vmd等等都可以将一个格点文件（静电势数据）投影到另一个格点文件（电子密度）的等值面上。但是色彩刻度都是连续的，不支持这种离散的方式。色彩刻度条自行用photoshop贴到图中合适的位置并标上数值即可。” |
4楼2011-12-13 08:58:01
sobereva
至尊木虫 (著名写手)
本人已永久离开小木虫
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zhou2009(金币+2): 2011-12-13 17:32:16
zhou2009(金币+2): 2011-12-13 17:32:16
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作图方法和相关讨论见此文 http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=3451419 |
5楼2011-12-13 13:36:11
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