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pcr
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| pcr扩增一段序列 这段序列中有一段连续重复的GCCTCC 扩增产物拿去测序比对 发现少了一个GCCTCC 有可能是pcr扩增过程中出现问题了吗? |
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3楼2011-12-13 09:38:37
cdl007
木虫 (正式写手)
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【答案】应助回帖
★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
amisking(金币+3): 鼓励积极应助! 2011-12-12 18:19:28
zds2257(金币+2): 引物结合位点没错 其他地方扩增也没什么错误 看来序列本来就这样 不过现在正在验证 2011-12-12 23:28:16
感谢参与,应助指数 +1
amisking(金币+3): 鼓励积极应助! 2011-12-12 18:19:28
zds2257(金币+2): 引物结合位点没错 其他地方扩增也没什么错误 看来序列本来就这样 不过现在正在验证 2011-12-12 23:28:16
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PCR反应是个概率事件 引物特异性结合在互补位置,但是也有可能结合在其他位置,这跟引物设计中的G自由能相关。 同时,taq酶的突变率1/1000,如果太长的序列,有错配是正常的, 但是楼主的序列正好差gcctcc,taq酶的突变不会这样, 建议楼主重新pcr,测序,或者多做几个孔,同时测序, 如果还有问题可以试试提高退火温度,或者重新设计一下上下游引物 |
2楼2011-12-12 13:21:30
4楼2012-01-14 11:56:30
wangdunzju
新虫 (小有名气)
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6楼2012-01-17 16:44:42












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