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阿德54007

金虫 (正式写手)

[求助] 如何对已经进行BLAST比对的序列进行功能预测已有1人参与

本人第一次做BLAST比对,在NCBI网站进行了BLASTx和BLASTn比对,得到和某些已确认的序列的相似度百分比,但是对于我要分析的序列可能具有的功能不知道怎么预测。以前我们实验室的做过BLAST2GO,现在这个软件的功能预测这个选项已经不能使用了。请各位大侠,详细指教。亲,有金币奖励哦。
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阳光温热,岁月静好,你还没来,我怎敢老
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uuu555000

捐助贵宾 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
阿德54007(西门吹雪170代发): 金币+2, 鼓励回帖交流 2014-05-15 21:27:17
是氨基酸序列还是核酸序列,氨基酸序列直接进行同源建模如swissmodel
核酸序列,进行ORF 预测orffinder,并验证用blastp,同源建模用swissmodel
无所谓好或不好,人生一场虚空大梦,韶华白首,不过转瞬,惟有天道恒在,往复循环,不曾更改
5楼2014-05-15 20:40:17
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