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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 计算Cl-在Fe表面吸附问题时体系加电荷方法
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kattygirl

铁虫 (初入文坛)

[求助] 计算Cl-在Fe表面吸附问题时体系加电荷方法

计算Cl-离子在Fe表面吸附时，我的算法是对cl原子加一个负电荷后，对整个体系赋予-1价，几何优化、能量计算后、结果计算出的吸附能为正值。
想请大侠们帮忙解决一下，这是哪方面的问题，会导致最后的吸附能为正值。
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1楼 2011-12-08 22:48:47
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Friday

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
14楼: Originally posted by acridine at 2011-12-15 23:34:45
首先说，MS是个大杂烩，虽然很方便但也容易出现误会。比如你们讨论的这个设置原子电荷的功能，并不一定是针对dmol或castep模块的设置。所以在使用这些设置之前，一定要看好帮助文件中的介绍。
另外关于体系中的离子 ...

回答的真好，懒人潜水也不得不出来点个赞！

发自小木虫Android客户端
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28楼2016-01-09 15:47:39
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acridine

木虫 (正式写手)
★ ★
sunyang1988(金币+2): 谢谢交流 2011-12-09 23:28:45
我认为有两点值得注意吧
首先，非电中性体系计算各种能量差的时候要特别小心。最好能详细给出你所采用的公式，以及每一项是怎么计算的，才能判断计算过程中是否有错误。
另一方面这种带电体系模型的意义，就是说你这里的模型是否应该带电，也是需要慎重考虑的。
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2楼2011-12-09 02:04:33
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kattygirl

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by acridine at 2011-12-09 02:04:33:
我认为有两点值得注意吧
首先，非电中性体系计算各种能量差的时候要特别小心。最好能详细给出你所采用的公式，以及每一项是怎么计算的，才能判断计算过程中是否有错误。
另一方面这种带电体系模型的意义，就是说 ...

非常感谢您的帮助，首先我用的计算公式是：吸附能=（能量计算后）吸附体系的总能量—清洁Fe(100)的能量—Cl-的能量，计算Cl-的能量时我是把cl原子加一个负电荷后放到10埃的立方盒子里面，几何优化、能量计算后得出的。其次，对于这种带电体系，对于加电荷的方式我不知道我这样对不对，但是我觉得为了保证电荷守恒，加一个带负电荷的氯离子在铁表面上，那么体系不是也应给再赋予给它一个负电荷吗？
希望您能指点我一下，万分感谢！
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3楼2011-12-10 21:10:23
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acridine

木虫 (正式写手)
★ ★ ★
sunyang1988(金币+3): 谢谢指点 2011-12-11 09:26:08
引用回帖:
3楼: Originally posted by kattygirl at 2011-12-10 21:10:23:
非常感谢您的帮助，首先我用的计算公式是：吸附能=（能量计算后）吸附体系的总能量—清洁Fe(100)的能量—Cl-的能量，计算Cl-的能量时我是把cl原子加一个负电荷后放到10埃的立方盒子里面，几何优化、能量计算后得 ...

第一个，关于公式，最好能有相关的参考文献对比。因为比较带电体系能量的时候需要进行能级的alignment，以使得能量具有可比性。这个过程在计算带电缺陷形成能的时候经常出现，不知道研究带电吸附的时候有没有类似的过程，找下相关文章吧。
第二个问题。首先，因为有些时侯离子是一种比较化学的、定性的描述，而实际体系中并不一定是这样的带电原子形式存在的。所以要先明确你模拟的体系是否真的是这种带负电的Cl原子参与。
另外就是模型的意义和合理性。我们想要模拟的是无限固体Fe表面的吸附，但由于计算的限制，我们只能建立吸附位置附近的结构模型。如果此时如果你让模型带电，那么其实模拟的是：电荷局域在吸附位置附近的情况。而实际上，即使真的有额外电荷引入，可能也不会局限在吸附位置附近，尤其这里的Fe还是导体。那么你的模型的合理性就有待商榷了。
以上只是我的看法了，我也没有具体研究过吸附，只当做建议就好了。
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4楼2011-12-11 00:48:00
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