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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » ME/Gulp » MS中Gulp模块下原子如何固定
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li_jinchun

金虫 (小有名气)

[求助] MS中Gulp模块下原子如何固定

目前，通过MS中Gulp软件模拟界面问题。为了使计算简单，想把界面一侧的原子固定。所以在modifity中的constraints中勾上了Fix Cartesian position 和Fix fractional postion，但是所固定的原子的坐标仍然变化，而且变化较大。
请问这是什么原因，如何解决这一问题，谢谢！
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1楼2011-12-07 22:43:00
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liwl926

金虫 (正式写手)
送红花一朵
引用回帖:
10楼: Originally posted by li_jinchun at 2015-10-07 15:03:02
我不太清楚“相连并固定”是为了什么，但是这种比较难实现，如果一定要这样算，我建议用简单的分子动力学程序去算。或者gulp中你可以把势修改。或者把原子标记改变，就是只考虑分子之间相互作用，不考虑分子内部相 ...

我希望把原子标记改变，就只考虑分子之间相互作用，不考虑分子内部相互作用。如何实现呢？求助！
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11楼2015-10-08 13:55:58
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andong1988

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
chaizhm(金币+1): 谢谢 2011-12-09 10:49:41
x,y,z前面勾了没有啊？只勾选笛卡尔坐标就可以了吧？
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哈哈哈哈
2楼2011-12-08 15:14:36
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li_jinchun

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by andong1988 at 2011-12-08 15:14:36:
x,y,z前面勾了没有啊？只勾选笛卡尔坐标就可以了吧？

如果只勾了Cartesian x y z的话，原子仍会移动，而且移动较大，有时原子直接就散了。
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3楼2011-12-09 09:55:54
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小虫_sang

铁虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by li_jinchun at 2011-12-09 09:55:54
如果只勾了Cartesian x y z的话，原子仍会移动，而且移动较大，有时原子直接就散了。...

同求此问题，楼主解决了吗？
赞一下 回复此楼
4楼2014-10-14 22:53:45
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