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yanyl09

禁虫 (初入文坛)
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1楼 2011-12-05 14:54:16
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yanyl09

禁虫 (初入文坛)
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4楼2011-12-06 15:58:49
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dbb627

荣誉版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

计算结果
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The more you learn, the more you know, the more you know, and the more you forget. The more you forget, the less you know. So why bother to learn.
6楼2011-12-06 17:56:32
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dingd

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

微分方程拟合推荐使用1stOpt，更强大方便些。
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2楼2011-12-05 17:01:18
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yanyl09

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3楼2011-12-06 09:02:08
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dbb627

荣誉版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

yanyl09(金币+10): 非常感谢，公式的修改对我启发很大，我再试试，谢谢！！！ 2011-12-06 22:37:09
我觉得你的模型不太对
我该了下，你试试，其实第一个生物量还是有问题，你没有考虑死亡率，估计改后会好些
CODE:
function AA
k0=[0.1 2 2];
x0=[0.01 54.026 0.2435];
t1=0:6:48;
tspan=0:6:48;
yexp=load('sample_file.txt')';
lb=[-10 -10 -10];ub=[10 10 10];
[k,resnorm,resid,exitflag,output,lambda,jacobian]=lsqnonlin(@ObjFunc4LNL8,k0,[0 0 0],[],[],x0,yexp);
ci=nlparci(k,resid,jacobian);
y1=[yexp(:,1)]';
y2=[yexp(:,2)]';
y3=[yexp(:,3)]';
[t4plot x4plot]=ode45(@kineticseqs8,[tspan(1) tspan(end)],x0,[],k);
plot(t1,y1,'bo',t1,y2,'g+',t1,y3,'r*',t4plot,x4plot,'k-'),
legend('Exp-biomass','Exp-glucose','Exp-butanol','Model'),
xlabel('time(h)'),ylabel('biomass dry weight(g/l),glucose(g/l),butanol(g/l)')
fprintf('Estimated Parameter\n'),
fprintf('\tk=%.4f %.4f\n',k(1),ci(1,2)-k(1))
fprintf('\tk=%.4f %.4f\n',k(2),ci(2,2)-k(2))
fprintf('\tk=%.4f %.4f\n',k(3),ci(3,2)-k(3))
[t,x]=ode45(@kineticseqs8,tspan,x0,[],k);
figure,plot(x,resid,'*')
xlabel('biomass dry wight(g/l)、glucose(g/l)、butanol(u/ml)'),
ylabel('Residuals(g/l,u/ml)')

function dxdt=kineticseqs8(t,x,k)
% dxdt=[k(1)*(1-x(2)./12)*x(1)
%    -k(2)*x(1).^2
%     k(3)*k(1)*(1-x(2)./12)*x(1)];
dxdt=[k(1)*x(1)*(1-x(1)/3)
   -k(2)*x(1)*x(2)
    k(3)*x(2)*x(1)];

function f=ObjFunc4LNL8(k,x0,yexp)
x0=[0.01 54.026 0.2435];
tspan=[0:6:48]';
[t1 x]=ode45(@kineticseqs8,tspan,x0,[],k);
y(:,1)=x(:,1);y(:,2)=x(:,2);y(:,3)=x(:,3);
f1=y(:,1)-yexp(:,1);f2=y(:,2)-yexp(:,2);f3=y(:,3)-yexp(:,3);
f=[f1 f2 f3];
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yanyl09
The more you learn, the more you know, the more you know, and the more you forget. The more you forget, the less you know. So why bother to learn.
5楼2011-12-06 17:55:00
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dingd

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

1stOpt求解代码：
CODE:
Variable t,x(3);
ODEFunction x1'=k1*x1*(1-x1/3);
            x2'=-k2*x1*x2;
            x3'=k3*x2*x1;
Data;
0        0.01        54.026        0.2435
6        0.37        51.6922        0.2578
12        1.41        45.8798        0.4849
18        2.24        37.4896        1.0704
24        2.59        28.0922        4.3128
30        1.94        15.5371        6.6818
36        1.98        3.6878        9.0772
42        0.89        0.3698        9.4994
48        0.001        0.4067        9.7617

参数                  最佳估算
--------------------        -------------
k1        0.105907029853778
k2        0.622112009922133
k3        0.10538762549862
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yanyl09
7楼2011-12-06 20:44:02
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yanyl09

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8楼2011-12-06 22:38:44
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yanyl09

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9楼2012-03-07 11:24:48
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迈阿密HEAT

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
9楼: Originally posted by yanyl09 at 2012-03-07 11:24:48
你好，我改了一下我的模型，考虑了死亡率，模型为
function dxdt=kineticseqs8(t,x,k)
dxdt=;
但是生物量的模拟曲线还是平的，模型改了好几次模拟曲线都是平的，不知道问题出在哪里，希望版主赐教，谢谢！...

请问输出来的结果是什么？是参数吗？怎么区分？

Estimated Parameter
        k=0.1059 0.0136
        k=0.6221 0.1550
        k=0.1054 0.0299
怎么对应的？
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10楼2014-11-07 22:29:57
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