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[求助]
【求助】有做含血红素的童鞋吗？求教啊……
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我想用amber对含血红素的蛋白进行分子动力学模拟，里面还有heme_all.db3的文件，但是我导入我的pdb文件后，提示找不到bond和angel参数…… 其实，我也有点看不明白这个heme_all.db3文件的每一项到底是什么意思…… 这是其中的一部分： 19 FE FE M 16 14 12 2.1000 124.0000 180.0000 20 NA NP S 19 16 14 2.0800 98.0000 90.0000 21 C1A CC S 20 19 16 1.3800 125.4000 90.0000 22 C2A CB B 21 20 19 1.4100 109.0000 180.0000 23 CAA CT 3 22 21 20 1.5100 124.0000 180.0000 谢谢！！！ |
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