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nnipp

金虫 (小有名气)

引用回帖:
10楼: Originally posted by fmtzhangli at 2011-12-01 10:36:14:
更改一下显示方式就可以了
把draw methods 改为DynamicBonds ,然后右边有定义成键的键长

psf文件是在NAMD模拟中用到拓扑文件,包含了成键情况,这对从头分子动力学应该没用

原来如此,非常感谢!
再请教一下,可以用CPK方式显示这种动态成键吗?另外对不同键类型可以分别定义成键距离吗?
功不唐捐
11楼2011-12-01 11:47:21
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fmtzhangli

金虫 (小有名气)

引用回帖:
11楼: Originally posted by nnipp at 2011-12-01 11:47:21:
原来如此,非常感谢!
再请教一下,可以用CPK方式显示这种动态成键吗?另外对不同键类型可以分别定义成键距离吗?

CPK方式显示应该不行,

另外对不同键类型可以分别定义成键距离吗?
这个你可以一个selection只选择成键的两个原子,然后设定cutoff
12楼2011-12-02 16:52:47
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