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nnipp

金虫 (小有名气)

[求助] CP2K 跑 MD 为什么分子跑到了周期性格子外面

用CP2K 跑 MD
定义了
&SUBSYS
    &CELL
      ABC 9.421    9.421    9.421
      ALPHA_BETA_GAMMA 94.20  94.20  94.20
    &END CELL

用VMD看.xyz文件 分子跑到了格子外面
如何让它显示在一个格子里?
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功不唐捐
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hakuna

木虫 (知名作家)

★ ★
ghcacj(金币+2): 谢谢 2011-11-28 11:59:20
没用过CP2K,周期性体系没关系吧,只要不违背周期性结构就行,如果要显示一个格子里,按周期性把格外的原子坐标平移一下应该就可以了。
2楼2011-11-27 16:21:44
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