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sunnyxun

禁虫 (初入文坛)
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1楼2011-11-22 14:22:32
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jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
月只蓝: 金币+3, 感谢指导！ 2014-02-26 11:20:04
引用回帖:
3楼: Originally posted by djdj123321 at 2014-02-26 10:41:32
请问下版主，第四步怎么弄的呢，我被卡在了第四步...

如果你是在XP系统下，走完第三步后，你的NAMD软件已经装好了。第四部就是开始运行你的模拟体系了。

你可以到NAMD 官网上找一个例子教程去试试。
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4楼2014-02-26 10:57:42
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jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
zh1987hs(金币+5): 鼓励新版~哈哈哈~ 2011-11-29 08:00:38
从网上转载的，我自己XP系统下的也是这样装的

1. 如果你下载的文件名中没有scr(scrous,源代码)，解压后里面有namd2或namd2.exe,psfgen或psfgen.exe 等，恭喜你，你可以直接使用。否则，寻找新的下载。

2.把解压后的目录放到一个你熟悉的地方，尽量不要有中文名。

3.设置环境变量，在win 下：右击我的电脑>属性>高级>环境变量>在系统变量中找的path>编辑>在后面加分号再把目录加上>确定；在linux 下：在你的~/.bashrc文件中加一行PATH=$PATH你的目录)

4.编辑*.pdb 文件,*.psf 文件，和配置文件，配置文件的后缀名不限，有*.in,*.namd,*.conf等，可以根据你的习惯。配置文件中注明pdb,psf,力场文件的位置，绝对目录相对目录都可以。

5.进入dos 窗口，cd 到配置文件所在目录，输入namd2.exe 配置文件即可
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2楼2011-11-28 21:28:58
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