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jackwangee金虫 (小有名气)
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[求助]
pull-code groamcs 算不了
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谁能知道错在哪吗？没拉动想拉的那个残基。 cpp = /usr/bin/cpp constraints = all-bonds integrator = md tinit = 0 dt = 0.001 nsteps = 10000000 init_step = 0 nstcomm = 1 nstxout = 1000 nstvout = 1000 nstfout = 1000 nstcheckpoint = 1000 ns_type = grid coulombtype = reaction-field epsilon_rf = 0 rlist = 1 rvdw = 1 rcoulomb = 1 tcoupl = berendsen tc_grps = system tau_t = 0.1 ref_t = 300 Pcoupl = no gen_vel = yes gen_temp = 300 pull = umbrella pull_geometry = position pull_dim = Y Y Y pull_r1 = 1 pull_r0 = 1.5 pull_constr_tol = 1e-06 pull_start = no pull_nstxout = 10 pull_nstfout = 1 pull_ngroups = 1 pull_group0 =as pull_pbcatom0 = 0 pull_group1 = 25 pull_weights1 = pull_pbcatom1 = 0 pull_vec1 = 5.0 0.0 0.0 pull_init1 = 0.0 0.0 0.0 pull_rate1 = 0.001 pull_k1 = 5000 |
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2楼2011-12-07 16:19:32
jackwangee
金虫 (小有名气)
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3楼2011-12-08 10:18:33
