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ssdyok木虫 (著名写手)
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求助：编辑的问题
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问题1 - Please recheck the positions of H1 and H2. I think that H1 is not well placed. Delete the two from the atom list. Do some cycles of refinements and plave H1 and H2 with help of the difference Fourier map. Then place the protons with: O1 6 0.532025 0.642637 0.206021 11.00000 0.05265 0.02086 = 0.06080 0.00192 0.01990 -0.00491 AFIX 2 H1 2 x y z 11.00000 -1.20000 AFIX 0 O2 6 0.432008 0.292037 0.154513 11.00000 0.05390 0.02536 = 0.05214 -0.01416 0.01485 -0.00338 AFIX 2 H3 2 x y z 11.00000 -1.20000 AFIX 0 where x y z are the positions from the Difference Fourier. For the oxygen atoms use the positions to which the proton is the closest. 问题2 - please check these points; maybe you should remove the protons and try to locate them by Fourier difference maps PLAT380_ALERT_4_G Check Incorrectly? Oriented X(sp2)-Methyl Moiety C2 PLAT380_ALERT_4_G Check Incorrectly? Oriented X(sp2)-Methyl Moiety C4 PLAT380_ALERT_4_G Check Incorrectly? Oriented X(sp2)-Methyl Moiety C6 PLAT380_ALERT_4_G Check Incorrectly? Oriented X(sp2)-Methyl Moiety C8 问题1和2应该是一样的解决方式吧？从Fourier difference maps中找出H，然后用编辑的方法命名？但如何看Fourier difference maps啊？怎么从里面找H？命名后还需要refine吗？？求具体的步骤，谢谢啦！ 问题3 -Insert _iucr_refine_instructions_details (=the last .res-file) in the cif-file. This is not mandatory, but highly recommended 让我把res复制进来吗？在哪段输入？格式是怎么样的？ 问题4 - Give the hall symbol 完全不明白什么意思 真诚请求各位高手的帮助！ |
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谢谢xi老师的回复 大概是因为有个这四个G错误，编辑让从新傅里叶加氢，这四个都是甲基 PLAT380_ALERT_4_G Check Incorrectly? Oriented X(sp2)-Methyl Moiety C2 PLAT380_ALERT_4_G Check Incorrectly? Oriented X(sp2)-Methyl Moiety C4 PLAT380_ALERT_4_G Check Incorrectly? Oriented X(sp2)-Methyl Moiety C6 PLAT380_ALERT_4_G Check Incorrectly? Oriented X(sp2)-Methyl Moiety C8 谢谢指点，checkcif看到了 Space group P 21/c Hall group -P 2ybc |
7楼2011-11-18 12:50:23
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4楼2011-11-18 10:23:53
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5楼2011-11-18 11:26:50
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